Analýza ovlivnění hladiny exprese genů v transgenní linii Arabidopsis thaliana po začlenění T-DNA inzerce do genomu

Mgr. Sabina Gomelská

Bachelor's thesis

Analysis of a gene expresion level caused by the T-DNA insertion in Arabidopsis thaliana transgenic line

Anotácia:

Široce využívanou a efektivní metodou pro charakterizaci funkce cílového genu v genomu se již před několika lety stala inzerce T-DNA. Řada účinných metod zajišťuje právě přenos cizorodých genů do rostlinných buněk. Jednou z nich je transformace pomocí Agrobacterium tumefaciens. Touto metodou byla včleněna T-DNA do genomu modelového organismu Arabidopsis thaliana, která ovlivila hladinu transkripce proteinové podjednotky telomerázy TERT (telomerázová reverzní transkriptáza). Sledován byl účinek T-DNA inzerce na transkripci AtTERT genu a posléze na telomerázovou aktivitu. Efekt této mutageneze může být různý v závislosti na pozici inzerce, její velikosti a dalších faktorech a výsledkem může být jak například úplná ztráta funkce genu, snížení aktivity tak její až několikanásobné zvýšení.

Abstract:

T-DNA insertion has become a widely used and effective method for characterisation of target gene functions several years ago. A number of effective methods provide transport of foreign gene into plant cells. One of these is Agrobacterium tumefaciens mediated transformation. Using this method the T-DNA insertion was introduced into the genome of model organism Arabidopsis thaliana. This insertion influenced transcription level of protein subunit of telomerase TERT (telomerase reverse transcriptase). I monitored the impact of T-DNA insertion on AtTERT gene transcription and telomerase activity. Outcome of this mutagenic process can vary depending on insertion situation, its extent and other factors, resulting in various cases, which can be e.g. total loss of gene function, decrease in gene activity as well as its exceptional growth.

Kľúčové slová

telomeráza, AtTERT, Arabidopsis thaliana, T-DNA, transgenní DNA, regulace exprese, úroveň transkripce, telomerázová aktivita, telomerase, transgenic DNA, regulation of the expression, transcription level, telomerase activity

Jazyk práce: Czech

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 14. 5. 2015

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 18. 6. 2015
• Vedúci: Mgr. Eva Sýkorová, CSc.

Masaryk University

Faculty of Science

Bachelor programme / odbor:
Biochemistry / Biochemistry