Funkční a druhová diverzita mikrobioty fylosfér vybraných druhů temperátních dřevin

Kristýna PAVLÍKOVÁ

Bakalářská práce

Functional and species diversity of microbiota of temperate tree phyllospheres

Anotace:

Bakalářská práce se zabývá funkční a druhovou diverzitou mikrobioty fylosfér vybraných druhů temperátních dřevin. Prvním cílem práce je vypracovat literární rešerši založenou na dosavadních znalostech mikrobioty povrchu listů u vybraných druhů rostlin, na který jsou prováděny výzkumy hostitelské specializace herbivorního hmyzu. Druhým cílem je vytvořit databázi druhů mikroorganismů, která zahrnuje potenciální typy interakce těchto mikroorganismů s hostitelskou rostlinou. Mikroorganismy mají řadu funkcí, které pozitivně, negativně či neutrálně působí na hostitelskou rostlinu. Na rozmanitost mikrobioty fylosféry mají vliv faktory jako je anatomie, fyziologie či mikroklima listů. Ačkoliv u mikrobioty fylosféry existuje již řada studií, které se zabývají mikrobiálním složením povrchu listů, celkově se o jejich potenciálních interakcích ví velmi málo. Předběžné výsledky z databáze však ukazují na relativně bohaté houbové společenstvo s nejpočetnějším rodem Cladosporium. V rámci mikrobioty fylosféry je málo početné bakteriální společenstvo, z něhož se nejčastěji vyskytovaly bakterie rodu Pseudomonas. Nejvíce zjištěných záznamů mikroorganismů je u stromu Fagus sylvatica a nejméně zjištěných záznamů mikroorganismů je u stromu Quercus alba. U interakce endofyt rostlin je zjištěno nejvíce záznamů mikroorganismů naopak nejméně zjištěných záznamů mikroorganismů je u interakce patogen hmyzu. Informace získané z databáze se mohou využít například k predikci interakcí mikroorganismů s hostitelskou rostlinou.

Abstract:

The bachelor thesis deals with the functional and species diversity of microbiota of temperate tree phyllosphere. The first aim is the elaboration of literary research based on the existing knowledge of microbiota leaf surfaces in selected plant species on which herbivorous insect research is being conducted. The second aim is to create a database of species of microorganisms that includes the types of interactions between these microorganisms and the host plant. Microorganisms have many functions that could positively, negatively or neutrally affect on the host plant. Various factors such as anatomy, physiology, or microclimate of leaves influence the diversity of the phyllosphere microbiota. Although the microbiota of the phyllosphere has a numbers of studies we know very little about their interaction, already. However, the precursor results from the database show up a relatively rich fungi community with the most numerous Cladosporium genus. Part of the phyllosphere microbiota is a small number of bacterial communities with the most frequent bacteria the Pseudomonas genus. The biggest number of detected microorganisms is found on the Fagus sylvatica tree. On the contrary the lowest number ofmicroorganisms is found on the Quercus alba tree. The most microorganisms records are found on plant endophyte interactions and the smallest interaction is found on the insect pathogen. The information obtained from the database can be used for example to predict interactions between microorganisms and the host plant.

Klíčová slova

fyloplan, bakterie, houby, interakce, patogen

Jazyk práce: čeština

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 23. 4. 2018

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 16. 5. 2018
• Vedoucí: doc. Mgr. Pavel Drozd, Ph.D.

OSTRAVSKÁ UNIVERZITA

Přírodovědecká fakulta

Bakalářský studijní program / obor:
Biologie / Experimentální biologie