Molekulární detekce Mycoplasma gallisepticum na základě celogenomových dat

Bc. Jakub KURÁŽ

Diplomová práce

Molecular detection of Mycoplasma gallisepticum based on whole genome data

Anotace:

Tato práce shrnuje základní poznatky o druhu Mycoplasma gallisepticum a navrhuje detekčně-rozlišovací metodu, která odlišuje tento druh od ostatních druhů rodu Mycoplasma. Optimalizací metody real time PCR bylo umožněno zpřesnění a zvýšení efektivity detekce unikátních sekvencí z genomu M. gallisepticum. Funkčnost a správnost metody byla posléze ověřena detekcí M. gallisepticum ve směsných vzor-cích ptačích a myších mykoplazem.

Abstract:

This thesis reviews the basic knowlegde of a bacteria Mycoplasma gallisepticum and attempts to propose a functional detection protocol to distinguish M. gallisepticum from related species of the genus Mycoplasma. Real time PCR optimalization has refined the specificity and increased the efficiency of detection of selected genomic loci for M. gallisepticum. The functionality and accuracy of the method was verified in laboratory experiments by detecting the occurrence of M. gallisepticum in mixed Mycoplasma samples.

Klíčová slova

Mycoplasma gallisepticum, Mollicutes, onemocnění drůbeže, bakterie, faktory viru-lence, detekce, vakcína, real time PCR, multiplex PCR, MAMA, mg2, glpK, potC, plpA, pvpA, Mycoplasma synoviae, Mycoplasma meleagridis, Mycoplasma imitans, Mycoplasma anatis, Mycoplasma pulmonis

Jazyk práce: čeština

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 22. 4. 2024

Obhajoba závěrečné práce

• Vedoucí: Ing. Pavel Beran, Ph.D.

JIHOČESKÁ UNIVERZITA V ČESKÝCH BUDĚJOVICÍCH

Fakulta zemědělská a technologická

Magisterský studijní program / obor:
Zemědělské biotechnologie / Zemědělské biotechnologie