Candidatus Phytoplasma mali - významný patogen jabloní a její vektoři

Kristýna Daniela KRUŤOVÁ

Bakalářská práce

´Candidatus Phytoplasma mali´- important pathogen of apple trees and its vectors

Anotace:

Tato bakalářská práce se zaměřuje na charakteristiku fytoplazmy proliferace jabloně (Candidatus Phytoplasma mali) a jejího vektora, meru Cacopsylla picta. Teoretická část práce je nejprve zaměřena na charakteristiku fytoplazem, jejich klasifikaci a metody detekce. Následně je zde popsána biologická a molekulárně genetická charakteristika fytoplazmy Candidatus Phytoplasma mali a jejích hlavních přenašečů Cacopsylla picta a Cacopsylla melanoneura. V experimentální části bakalářské práce bylo pracováno se 45 vzorky mer Cacopsylla picta pocházejícími ze čtyř lokalit na Moravě. Pomocí Sangerova sekvenování CPF4/CPR4 PCR amplikonů byly získány parciální sekvence COI u 26 jedinců Cacopsylla picta o délce cca 700 bp. Následným vyhodnocením studovaných vzorků pomocí p-distance metody byla u většiny vzorků zjištěna 99-100% identita COI nukleotidové sekvence se sekvencemi Cacopsylla picta původem z Itálie získanými z databáze GenBank. Pomocí fylogenetické analýzy byla prokázána homogenita genotypů studovaných jedinců bez ohledu na jejich geografický původ, kteří se rozdělili do dvou fylogenetických skupin.

Abstract:

This bachelor thesis focuses on the characterization of the proliferating phytoplasma of apple (Candidatus Phytoplasma mali) and its vector, the psyllid Cacopsylla picta. The theoretical part of the thesis is first focuses on the characteristics of phytoplasmas, their classification and detection methods. Subsequently, the biological and molecular genetic characteristics of the phytoplasma Candidatus Phytoplasma mali and its main vectors Cacopsylla picta and Cacopsylla melanoneura, are described. In the experimental part of the bachelor thesis, 45 samples of Cacopsylla picta were collected from four sites in Moravia. Using Sanger sequencing of CPF4/CPR4 PCR amplicons, partial COI sequences were obtained for 26 individuals of Cacopsylla picta with lenght of about 700 bp. Evaluation of the samples studied using the p-distance method showed 99-100% identity of the COI nucleotide sequences with Cacopsylla picta sequences from Italy obtained from the GenBank database. Phylogenetic analysis confirmed the homogeneity of genotypes of the individuals studied, regardless of their geographical origin and it allowed their discrimination into two main phylogenetic clusters.

Klíčová slova

Candidatus Phytoplasma mali, metoda PCR, Cacopsylla picta

Jazyk práce: čeština

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 13. 4. 2023

Obhajoba závěrečné práce

• Vedoucí: Mgr. Dana Šafářová, Ph.D.

UNIVERZITA PALACKÉHO V OLOMOUCI

Přírodovědecká fakulta

Bakalářský studijní program / obor:
Biologie / Molekulární a buněčná biologie