Algoritmická analýza struktury vazebných míst cukrů – Bc. Lukáš Hanušovský
Bc. Lukáš Hanušovský
Master's thesis
Algoritmická analýza struktury vazebných míst cukrů
Algoritmic structural analysis of sugar binding sites
Abstract:
Díky vysoce efektivním metodám strukturální analýzy máme dostupný velký počet dat, která se týkají 3D struktury proteinů. V této práci studujeme strukturní motivy vazebných míst cukrů v proteinech a možnosti využití algoritmických přístupů pro toto studium. Práce obsahuje obecnou analýzu výskytu aminokyselin v okolí cukrů. Dále pokračuje aplikací kombinatorického algoritmu při hledání skupin podobných …moreAbstract:
Thanks to the highly efficient methods of structural analysis, we have available a large amount of data pertaining to 3D structures of proteins. In this thesis we study the structural motifs of sugar binding sites and possibility of using the algorithmic approaches for this study. The work contains a general analysis of amino acids occurrence in the environment of sugar. Then it continues with the …more
Language used: English
Date on which the thesis was submitted / produced: 15. 5. 2013
Identifier:
https://is.muni.cz/th/jma8n/
Thesis defence
- Date of defence: 13. 6. 2013
- Supervisor: doc. RNDr. Radka Svobodová Vařeková, Ph.D.
Citation record
Full text of thesis
Contents of on-line thesis archive
Published in Theses:- světu
Other ways of accessing the text
Institution archiving the thesis and making it accessible: Masarykova univerzita, Přírodovědecká fakultaMasaryk University
Faculty of ScienceMaster programme / field:
Biochemistry / Chemoinformatics and Bioinformatics
Theses on a related topic
-
Charakteristika vazby nádorových supresorů na strukturní motivy DNA
Pavlína Mrhálková -
Charakterizace fylogeneticky divergovaných strukturních motivů telomerické DNA
Martin Gajarský -
Strukturní dynamika biomolekulárních komplexů
Pavlína Pokorná -
Strukturní analýza proteinu ZCCHC9 pomocí NMR spektroskopie
Kateřina Linhartová -
Analysis of Protein Structural Motifs
David Sehnal -
Detekce strukturních homologů v Protein Data Bank
Veronika Lásková -
Analýza vazebných míst cukrů v proteinech
Martin Nováček