Back to search

Mgr. Miroslav Jurásek, Ph.D.

Doctoral thesis

Multiscale simulations of protein-protein interactions

Multiscale simulations of protein-protein interactions
Abstract:
Tato dizertační práce se zabývá studiem protein-membrána a protein-protein interakcí za použítí modelů s různou úrovní zhrubení pomocí metod molekulové dynamiky a Monte Carlo simulací. V práci je použita celá řada modelů od vysoce zhrubených modelů, kde je celý protein aproximován jednou částicí s povrchovou interakcí, až po atomární modely. Použítí modelů s různým rozlišením nám tak umožňilo studovat …more
Abstract:
In this dissertation thesis, we studied protein-membrane and protein-protein interactions in models with different levels of coarse-graining via methods of molecular dynamics and Monte Carlo simulations. We employed variety of models ranging from highly coarse-grained ones, where the whole protein is approximated by a single patchy particle, to atomistic models. The use of models with different resolution …more
 

Keywords

Simulace Molekulová dynamika Monte Carlo Proteiny Lipidové membrány DivIVA protein Dishevelled protein Wnt signální dráha PDZ doména Samouspořádané systémy Simulations Molecular dynamics Proteins Lipid membranes Wnt signaling pathway PDZ domain Self-assembled systems
 
Language used: English
Date on which the thesis was submitted / produced: 23. 9. 2020
Identifier: https://is.muni.cz/th/cslt7/

Thesis defence

  • Date of defence: 13. 1. 2021
  • Supervisor: doc. RNDr. Robert Vácha, PhD.
  • Reader: prof. Dr. hab. Lukasz Cwiklik, Ph.D., RNDr. Mgr. Jan Heyda, Ph.D.

Citation record

Cite this text

Full text of thesis

Contents of on-line thesis archive
Published in Theses:
  • světu
Other ways of accessing the text
Institution archiving the thesis and making it accessible: Masarykova univerzita, Přírodovědecká fakulta
Složka Reference to the local database directory of the institution