Genetický polymorfismus vybraných kódujících lokusů ve vztahu k technologickým vlastnostem masa

Bc. Kateřina KOUBOVÁ

Diplomová práce

Genetic polymorphism of selected loci in relationship to technological traits of meat

Anotace:

V diplomové práci byla provedena genotypizace 162 jatečných býků plemene ČESTR pocházejících z komerčních chovů, která měla za úkol analyzovat potencionální vliv genu kódujícího calpain I (CAPNI) na výslednou křehkost masa. CAPN1 přítomný na chromozomu BTA29, byl ve dřívějších studiích hodnocen jako kandidátní gen pro QTL. Polymorfismus genu CAPNI byl analyzován pomocí metody PCR/RFLP za použití markeru CAPN530. Výsledkem celé metody bylo stanovení genotypů. U homozygotů AA byl odečten jeden fragment o délce 341 bp, u homozygotů GG dva fragmenty o délkách 195 a 146 bp a u heterozygotů AG tři fragmenty o délkách 341, 195 a 146 bp. Výsledky genotypizace byly následně statisticky vyhodnoceny. Ve studované populaci býků bylo zjištěno 11 homozygotů AA, 62 homozygotů GG a 89 heterozygotů AG. Četnější Alela G se v populaci vyskytovala s frekvencí 0,657 a méně četná alela A pak s frekvencí 0,343. Pro stanovení křehkosti masa u jednotlivých býků bylo zvoleno hodnocení velikosti střižné síly pomocí Warner-Bratzlerova shear testu. Měřeny byly vzorky syrového a grilovaného masa vždy 1., 14. a 28. den po porážce. K vyhodnocení vztahu mezi genotypem a velikostí střižné síly bylo využito statistických metod. V případě syrového masa byl zjištěn významný vliv pouze u síly ve střihu měřené u vzorků 1. den po porážce. U genotypu AG bylo dosaženo nejpříznivějších výsledků pro sledovaný parametr. U vzorků měřených 14. a 28. den po porážce nebyl zjištěn žádný vliv genotypu na sílu ve střihu, potažmo křehkost masa. U masa grilovaného nebyl zjištěn žádný významný vliv genotypu na sílu střihu ani v jednom dni měření. Lze konstatovat, že vliv genotypu na křehkost grilovaného masa je u našeho panelu zvířat naprosto minimální a nelze jej statisticky prokázat.

Abstract:

Within the framework of this diploma, a genotypization of 162 beef cattle of the ČESTR commercial breed from was performed in order to analyze the potential influence of gene coding calpain I (CAPNI) on the resulting beef tenderness. CAPN1 present on the BTA29 chromosome, was selected in previous studies as a candidate gen for QTL. Polymorphism of CAPNI gene was studied using PCR/RFLP method and CAPN530 marker. Genotype identification resulted from this procedure. A 341 bp long fragment was present in homozygotes AA, two fragments of 195 and 146 bp were present in homozygotes GG, and three fragments of 341, 195 and 146 bp were detected in heterozygotes AG. The genotypization output was subsequently statistically evaluated. 11 homozygotes AA, 62 homozygotes GG and 89 heterozygotes AG were detected in the analyzed beef cattle population. More frequent G allele occurred in the set with the frequency of 0,657 and A allele with the frequency of 0,343. Warner-Bratzler shear test was employed to determine beef tenderness based on the shear force attribute. Samples of raw and grilled beef aging 1, 14 and 28 days after the slaughter were analyzed. Statistical methods were used to evaluate relationship between genotype and detected amount of shear force. In case of raw beef, only the samples aging 1 day after the slaughter showed significant difference in the shear force. The most positive results for the given parameter were achieved in case of AG genotype. Samples aging 14 and 28 days after the slaughter showed no difference in shear force and related beef tenderness, indicating no genotype influence. In case of grilled beef, no significant difference in sheer force indicating possible genotype influence was detected at any day of analysis. Genotype influence on grilled beef tenderness within the test animal population is minimal and statistically inconclusive.

Klíčová slova

křehkost masa, calpain, CAPNI, polymorfismus, ČESTR, PCR/RFLPs

Jazyk práce: čeština

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 27. 4. 2012

Zveřejnit od: 27. 4. 2012

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 20. 6. 2012
• Vedoucí: Ing. Lenka Hanusová

JIHOČESKÁ UNIVERZITA V ČESKÝCH BUDĚJOVICÍCH

Zemědělská fakulta

Magisterský studijní program / obor:
Zemědělské inženýrství / Živočišné biotechnologie