Efekt fosforylace proteinu MAP2c prolinem řízenými kinázami

Bc. Václav Dvorský

Bakalářská práce

Effect of phosphorylation of proline-directed kinases on MAP2c

Anotace:

Tato práce se soustředí na odhalení a přidělení fosforylace proteinu asociovaného s mikrotubuly, MAP2c, pomocí kinázy glykogen syntázy, GSK-3β. Fosforylace je důležitá pro schopnost MAP2c stabilizovat mikrotubuly. Každá přirozeně přítomná kináza fosforyluje MAP2c unikátním způsobem. Pro analýzu jsme použili kombinaci predikčního softwaru, hmotnostní spektrometrie a NMR experimentů, a dále kombinaci MAP2c a jeho mutantů, pro které byly vybrané potenciálně fosforylovatelné aminokyseliny vhodně nahrazeny. Soustředili jsme se na pár prvních míst a porovnání dat získaných jednotlivými metodami.

Abstract:

This thesis focuses on determination and assignment of phosphorylation sites of microtubule-associated protein-MAP2c by glycogen synthase kinase-GSK-3β. Phosphorylation is important for MAP2c function to stabilise microtubules. Each natively presented kinase phosphorylates MAP2c in unique pattern. For analysis, we used phosphorylation prediction, mass spectrometry and NMR experiments with a combination of MAP2c and its mutants, where possible phosphorylation sites have been discarded. It focused on few early-discovered residues and comparison of data of individual methods.

Keywords

nuclear magnetic resonance (NMR), heteronuclear single-quantum coherence (HSQC), microtubule-associated protein 2c (MAP2c), phosphorylation, intrinsically disordered proteins (IDP), glycogen synthase kinase 3-β (GSK-3β), protein kinase A (PKA)

Jazyk práce: angličtina

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 1. 6. 2021

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 9. 7. 2021
• Vedoucí: PhD. Séverine Jansen
• Oponent: Mgr. Monika Kubíčková, Ph.D.

Masarykova univerzita

Přírodovědecká fakulta

Bakalářský studijní program / obor:
Biochemie / Biochemie