Bc. Marek Havrila, Ph.D.
Master's thesis
Struktura a dynamika RNA
Structure and dynamics of RNA
Abstract:
This thesis deals with the study of base mutations in sarcin/ricin motif using molecular dynamics simulations and bioinformatics approaches. The aim of the study is to discover how the structure of the sarcin/ricin motif depends on its seqence. There is the stucture of the RNA molecules, basics of database searching for RNA molecules and principals of molecular dynamics described in the theoretical …moreAbstract:
Táto práca sa zaoberá štúdiom mutácií báz v sarcín/ricín motíve pomocou molekulových dynamických simulácií a bioinformatických metód. Cieľom práce je odhaliť štruktúrne vlastnosti sarcín/ricín motívu v závislosti na jeho sekvencii. V teoretickej časti opisuje štruktúru RNA, metódy vyhľadávania štruktúr RNA v databázach a teoretické základy molekulovej dynamiky. V praktickej časti uvádza zoznam 57 nájdených …more
Language used: Slovak
Date on which the thesis was submitted / produced: 11. 5. 2012
Identifier:
https://is.muni.cz/th/bj1ru/
Thesis defence
- Date of defence: 21. 6. 2012
- Supervisor: prof. RNDr. Jiří Šponer, DrSc.
Full text of thesis
Contents of on-line thesis archive
Published in Theses:- světu
Other ways of accessing the text
Institution archiving the thesis and making it accessible: Masarykova univerzita, Přírodovědecká fakultaMasaryk University
Faculty of ScienceMaster programme / field:
Physics / Biophysics
Theses on a related topic
-
Struktura a dynamika RNA
Marek Havrila -
Reaction mechanisms of glycosyltransferases studied by Ab Initio molecular dynamics
Pavel Janoš -
Three dimensional structure determination of a biopolymer using molecular dynamics and experimental restraints measured in isotropic media and oriented phases
Josef Chmelík -
Struktura, dynamika a vazebné vlastnosti cyklických a acyklických oligomerů obsahujících glykoluril
Matej Krajčo -
Struktura glykosyltransferázy toxinu TcdB s nativním substrátem
Náth Vozábal -
Vysvětlení sekvenčních preferencí rekurentních RNA motivů pomocí metod kvantové chemie: Dinukleotidová RNA platforma
Arnošt Mládek -
Struktura a dynamika RNA
Marek Havrila