Hodnocení genetické variability populace československého vlčáka na základě genetických profilů

Bc. Magdaléna Vaňková

Diplomová práce

Genetic variability of Czechoslovakian Wolfdog population based on genetic profiles

Anotace:

Tato diplomová práce se zabývá analýzou genetické variability a struktury populace československého vlčáka pomocí mikrosatelitových markerů. Plemeno, které vzniklo křížením německého ovčáka a karpatského vlka, má poměrně úzkou genetickou základnu a je rozděleno do osmi linií podle zakládajících předků. Cílem práce bylo zhodnotit úroveň genetické variability v celé populaci a mezi osmi skupinami definovanými zakladatelem. Byly analyzovány vzorky 111 jedinců pomocí vybraných STR markerů. Hodnoceny byly ukazatele jako počet alel, heterozygotnost, polymorfismus, inbrední koeficient a genetická struktura pomocí modelu STRUCTURE. Výsledky ukázaly, že použité markery jsou dostatečně informativní a celková variabilita v populaci je relativně vyrovnaná. U některých skupin se objevily známky mírného inbreedingu, jiné vykazovaly vyšší než očekávanou heterozygotnost. Analýza genetické struktury odhalila čtyři geneticky odlišitelné klastry, avšak bez výrazného oddělení mezi skupinami podle zakladatele, jelikož vzájemně dochází k mísení linií. Závěrem práce je, že současná populace československého vlčáka se tak jeví jako geneticky homogenní s mírně vyjádřenou strukturou a udržuje si určitou genetickou variabilitu bez výraznějšího vnitřního členění. Výsledky mohou sloužit jako základ pro optimalizaci chovatelských strategií k udržení genetického zdraví a pro budoucí analýzy genetické diverzity u plemen psů.

Abstract:

This thesis deals with the analysis of genetic variability and population structure of the Czechoslovak Wolfdog using microsatellite markers. The breed, which originated from the cross between the German Shepherd Dog and the Carpathian Wolf, has a relatively narrow genetic base and is divided into eight lineages according to the founding ancestors. The aim of this study was to assess the level of genetic variation in the whole population and among the eight groups defined by the founder. Samples of 111 individuals were analyzed using selected STR markers. Markers such as allele number, heterozygosity, inbreeding coefficient polymorphism and genetic structure were evaluated using the STRUCTURE model. The results showed that the markers used were sufficiently informative and the overall variability in the population was relatively balanced. Some groups showed evidence of slight inbreeding, while others showed higher than expected heterozygosity. Analysis of the genetic structure revealed four genetically distinguishable clusters, but no significant separation between groups by founder, as there is intermixing of lineages. In conclusion, the current population of the Czechoslovakian Wolfhound appears to be genetically homogeneous with a moderately expressed structure and maintains some genetic variability without significant internal subdivision. The results may serve as a basis for optimizing breeding strategies to maintain genetic health and for future analyses of genetic diversity in dog breeds.

Klíčová slova

čsv, genetický profil, genetika populací, československý vlčák, mikrosatelity

Keywords

Czechoslovakian Wolfdog, CSW, microsatellites, genetic profile, population genetic

Jazyk práce: čeština

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 21. 4. 2025

Obhajoba závěrečné práce

• Vedoucí: Ing. Jakub Vašek, Ph.D.

Česká zemědělská univerzita v Praze

Fakulta agrobiologie, potravinových a přírodních zdrojů

Magisterský studijní program:
Zájmové chovy zvířat