Mgr. Adam Krejčí, Ph.D.

Doctoral thesis

Nové bioinformatické metody pro globální analýzu peptidových knihoven

Novel bioinformatics methods for global analysis of peptide libraries
Abstract:
Práce se zabývá vývojem softwarového nástroje pro shlukování velkého množství peptidových sekvencí na základě sdílených sekvenčních motivů. Výsledný nástroj je následně aplikován na data z experimentů využívajících metodu phage display společně se sekvenováním nové generace (NGS) k detailnímu určení epitopů protilátek včetně polyklonálních sér.
Abstract:
The main topic of this work is the development of a software tool for clustering of peptide sequences on the basis of shared sequence motifs. The tool is then applied on data from phage display experiments sequenced using next generation sequencing (NGS) to obtain detailed descriptions of binding specificities of various antibodies including polyclonal sera.
 

Keywords

bioinformatika bioinformatics NGS phage display peptid peptide antibody protilátka software sequence sekvence clustering shluková analýza
 
Language used: English
Date on which the thesis was submitted / produced: 30. 10. 2017
Identifier: https://is.muni.cz/th/ppzog/

Thesis defence

  • Date of defence: 9. 1. 2018
  • Supervisor: MUDr. Petr Müller, Ph.D.
  • Reader: doc. Ing. Vojtěch Spiwok, Ph.D., Mgr. Marian Novotný, Ph.D.

Citation record

Cite this text

Full text of thesis

Contents of on-line thesis archive
Published in Theses:
  • světu
Other ways of accessing the text
Institution archiving the thesis and making it accessible: Masarykova univerzita, Přírodovědecká fakulta
Složka Reference to the local database directory of the institution

Masaryk University

Faculty of Science

Doctoral programme / field:
Biology (4-years) / Molecular and Cellular Biology

Theses on a related topic

List of theses with an identical keyword.