Využití paramagnetických částic pro izolaci oligonukleotidů s různou sekvencí nukleobazí

Bc. Jana Bartošková

Bakalářská práce

Using of paramagnetic particles for the isolation of oligonucleotides with different sequences of bases

Anotace:

Cílem této bakalářské práce, která se zabývá izolací ODN pomocí paramagnetických mikročástic (MPs), bylo nalézt odpovědi na dvě důležité otázky. Jaký vliv má sekvence ODN na proces izolace a zda tato izolace ovlivňuje vlastnosti a strukturu ODN.Koncentrace a poměr zastoupení bází adeninu (A) a cytosinu (C) ve vybraných ODN (osmnáctimerech) byly stejné, lišila se však jejich sekvence. ODN byly před izolací i po izolaci zkoumány pomocí voltametrie (LSV) a na rtuťové kapkové elektrodě byl detekován společný redukční pík A a C. Pro zvýšení koncentrace ODN na povrchu pracovní elektrody bylo využito adsorptivní přenosové techniky umožňující detekci stopových množství analytu (jednotky mikrolitrů).

Abstract:

The aim of this Bachelor’s thesis was to answer two main questions: how is the effect of ODN sequences on the process of their isolation using magnetic microparticles (MPs) and how this microscale isolation ODN affects the properties and structure of the ODN.To compare the results oligonucleotides with same length were selected. It means that the concentration and the ratio of representation bases adenine (A) and cytosine (C) in the ODN were the same, but the sequence in the ODN chain differed. ODN, before and after isolation, was subjected to voltammetric analysis consisting of the detection of common reductive peak A and C on a mercury electrode. To use a small volume of ODN sample the adsorptive transfer stripping was applied.

Klíčová slova

ODN, izolace NK, paramagnetiské částice, elektochemie, voltametrie, redukce A+C

Jazyk práce: čeština

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 14. 5. 2010

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 14. 6. 2010
• Vedoucí: prof. RNDr. Libuše Trnková, CSc.

Masarykova univerzita

Přírodovědecká fakulta

Bakalářský studijní program / obor:
Biochemie / Biochemie