Molekulární a cytogenetická charakterizace 'East African Highland' banánovníků

Bc. Alžběta NĚMEČKOVÁ

Master's thesis

Molecular and cytogenetic charakterization of 'East African Highland' bananas

Abstract:

Předložená diplomová práce se zabývá molekulární a cytogenetickou charakterizací vybraných druhů 'East African Highland' banánovníků (dále jen EAHB) se snahou objasnit původ těchto triploidních jedlých kultivarů. Cytogenetická charakterizace byla založená na mapování 45S a 5S rDNA lokusů pomocí fluorescenční in situ hybridizace, předmětem molekulární charakterizace byla analýza ITS1-5.8S-ITS2 oblasti. Předmětem teoretické části diplomové práce bylo vypracovat literární rešerši, která se zabývala současnou problematikou, morfologickým popisem, taxonomickým zařazením, významem, šlechtěním, dále popisem EAHB banánovníku a jednotlivými cytogenetickými a molekulárními technikami používanými při charakterizaci banánovníků. V praktické části byla charakterizována variabilita 5S a 45S rDNA lokusů v genomu - na metafázních preparátech mitotických chromozómů s využitím fluorescenční in situ hybridizace a dále byla analyzována ITS oblast 45S rDNA lokusu u vybraných zástupců EAHB banánovníků. Na základě provedených analýz bylo zjištěno, že tyto jedlé triploidní východoafrické kultivary pocházejí pravděpodobně z jednoho klonu, na jehož vzniku se jistým dílem podílely dva poddruhy M. acuminata - zebrina a banksi. A zcela nově se ukazuje, že jistý podíl na vzniku tohoto genotypu měla i M. schizocarpa.

Abstract:

The presented thesis deals with molecular and cytogenetic characterisation of selected species of East African Highland bananas (hereinafter EAHB), trying to explain the origin of these edible triploid cultivars. The cytogenetic characterisation was based on the mapping of 45S and 5S rDNA loci using fluorescence in situ hybridisation. The subject of molecular characterisation was analysis of ITS1-5.8S-ITS2 region. The objective of theoretical part of this thesis was to devise a literature review, which is focused on current issues, morphological descriptions, taxonomic classification, importance, breeding, description of EAHB bananas and individual cytogenetic and molecular techniques used in the characterisation of bananas. In the experimental part, variability of 5S and 45S rDNA loci in the genome was characterised using the metaphase preparations of mitotic chromosomes by fluorescence in situ hybridisation and the ITS region of 45S rDNA locus in selected representatives of EAHB was also analysed. Based on executed analyses, it was found that these edible triploid East African cultivars probably originate from a single clone on whose formation two subspecies of M. acuminata - zebrina and banksi partially contributed. As a new finding, it appears that also M. schizocarpa had a certain contribution in formation of this genotype.

Keywords

East African Highland banánovník, cytogenetická charakterizace, molekulární charakterizace

Language used: Czech

Date on which the thesis was submitted / produced: 28. 4. 2016

Accessible from:: 28. 4. 2016

Thesis defence

• Supervisor: Mgr. Eva Hřibová, Ph.D.

PALACKÝ UNIVERSITY OLOMOUC

Faculty of Science

Master programme / field:
Biology / Molecular and Cell Biology