Frontend of the AEON Sketchbook application

Bc. Petr Ivičič

Diplomová práce

Anotace:

Tato diplomová práce se zaměřuje na vývoj uživatelské části aplikace AEON Sketchbook, která je určena pro inferenci Booleovských sítí na základě biologických předpokladů a pozorování. Výsledkem této práce je implementace frontendu založená na Web komponentách pomocí frameworku Lit. Frontend efektivně komunikuje s backendem a udržuje jeho kontrolu nad stavem aplikace. Implementace zahrnuje různé komponenty, včetně navigace, editorů pro regulační sítě a síťové funkce, seznamu pozorování/vlastností a dalších nezbytných dialogů či podoken.

Abstract:

This Master’s thesis focuses on the development of the user-facing part of the AEON Sketchbook, an application designed for the inference of Boolean networks from biological assumptions and observations. The result of this thesis is a Web component based implementation of frontend using the Lit framework. The frontend efficiently communicates with backend and keeps it in control of the application's state. The implementation covers various components, including window navigation, editors for regulatory networks and network functions, a list of observations/properties, and additional necessary dialogs or sub-windows.

Keywords

AEON, Bifurcation, Boolean Network, CSS, Decision Tree, HTML, JavaScript, Regulatory Network, Rust, SYBILA, Systems Biology, TypeScript, Visualization, Web Application

Jazyk práce: angličtina

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 21. 5. 2024

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 17. 6. 2024
• Vedoucí: RNDr. Samuel Pastva, Ph.D.
• Oponent: doc. RNDr. David Šafránek, Ph.D.

Masarykova univerzita

Fakulta informatiky

Magisterský studijní program / obor:
Softwarové inženýrství / Návrh a vývoj softwarových systémů