Identifikace genů vázaných na pohlavní chromozomy u Silene latifolia a Silene dioica

Bc. Zuzana Machálková

Diplomová práce

Identification of sex-linked genes in Silene latifolia and Silene dioica

Anotace:

Silene latifolia a Silene dioica jsou blízce příbuzné dvoudomé druhy rostlin s odděleným pohlavím, které je determinováno přítomností pohlavních chromozomů X a Y. Pohlavní chromozomy S. latifolia a S. dioica jsou mladší (10-20 milionů let) než u savců (cca 200 milionů let). Tyto dva druhy jsou proto důležitým modelem pro studium časných stádií evoluce pohlavních chromozomů. V této práci byla analyzována skupina genů vázaných na pohlavní chromozomy (Sl3, Sl7, DD44). Tyto geny byly de-novo izolovány pro S. dioica pomocí screenování BACové knihovny. Společně pro S. latifolia a S. dioica byly následně metodami Real-Time PCR a HRM porovnány exprese těchto genů v různých pletivech. Metodou low-copy FISH (fluorescenční in situ hybridizace) vytvořena fyzická mapa pro jednotlivé geny. Tato mapa je doposud nejpodrobnější fyzickou mapou, vytvořenou pro blízce příbuzné druhy rodu Silene.

Abstract:

Silene latifolia and Silene dioica are closely related dioecious plant species where sex is determined by the presence of sex chromosomes, X and Y. The sex chromosomes of S. latifolia and S. dioica are younger (10-20 million years) than in mammals (about 200 million years). These two species are thus important models for the study of early stages of sex chromosomes evolution. In this work a group of genes linked to sex chromosomes (Sl3, Sl7, DD44) was analyzed. These genes were de-novo isolated from S. dioica by screening of the BAC library. The expression of these genes in different tissues was compared using Real-Time PCR and HRM in S. latifolia and S. dioica. Using the low-copy FISH (fluorescence in situ hybridization) method, a physical map for individual genes was created. This map is the most detailed physical map created for closely related Silene species.

Klíčová slova

evoluce, BAC knihovny, RT-PCR, HRM, low-copy FISH

Keywords

BAC library, low-copy FISH, evolution, RT-PCR, HRM

Jazyk práce: čeština

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 27. 4. 2017

Obhajoba závěrečné práce

• Vedoucí: RNDr. Roman Hobza, Ph.D.
• Oponent: Luboš Majeský, externi

Mendelova univerzita v Brně

Agronomická fakulta

Magisterský studijní program / obor:
Fytotechnika / Biotechnologie rostlin