Bakteriální biofilmy

Ing. Jan MACH

Bachelor's thesis

Bacterial biofilms

Abstract:

Biofilmy jsou vytvářeny mikrooganismy při kolonizaci pevných substrátů. Z biologického hlediska pak přestavují velice specifickou a organizovanou formu interakcí jednotlivých bakteriálních buněk mezi sebou i se svým okolím. Biologické projevy jednotlivých buněk jsou potom značně odlišné od jejich chování v tekutých kulturách či koloniích na agarových půdách. Cílem práce bude rešerše literárních poznatků o biofilmech vytvářených bakteriemi s důrazem na mykobakteriální biofilmy. Praktickou částí pak bude příprava bakteriálního biofilmu laboratorního kmene mykobakterií (Mycobacterium smegmatis) a sledování tvorby tohoto biofilmu v čase. Základem pro práci je schopnost čerpat z anglické vědecké literatury a využívat databázové zdroje UJEP a případně i MBÚ AV ČR. Kultivace biofilmů bude provedena ve spolupráci s RNDr. Jaroslavem Weiserem, CSc. z Mikrobiologického ústavu AV ČR. Mikroskopické analýzy pomocí optické a skenovací elektronové mikroskopie budou prováděny pod vedením RNDr. Oldřicha Benady, CSc. v Mikrobiologickém ústavu AV ČR v Praze a na KBI UJEP v Ústí nad Labem.

Abstract:

Biofilms are created by micro-organisms during colonization of solid substrates. From a biological point of view they represent a very specific and organized form of interactions of individual bacterias with each other and with their environment. Biological expressions of individual cells are then very different from their behavior in liquid cultures or colonies on agar soils. The aim of the work will be the research of literary knowledge of biofilms with emphasis put on mycobacterial biofilms. The practical part then consists in preparation of the bacterial biofilm of the mycobacteria laboratory strain (Mycobacterium smegmatis) and monitoring of biofilm formation in time. The basis of the work is the ability to draw information from the English scientific literature and use database resources of the Jan Evangelista Purkyně University and possibly even the resources of the Institute of Microbiology, ASCR, v. v. i. Cultivation of biofilms will be performed in collaboration with Dr. Jaroslav Weiser, PhD. from the Institute of Microbiology, ASCR, v. v. i. The microscopic analysis using optical and scanning electron microscopy will be carried out under the leadership of Dr. Oldřich Benada, PhD, in the Institute of Microbiology, ASCR, v. v. i. in Prague and in the Biology department of the Jan Evangelista Purkyně University.

Keywords

bakteriální biofilmy, bakterie, elektronová mikroskopie, mycobacterium smegmatis

Language used: Czech

Date on which the thesis was submitted / produced: 23. 4. 2014

Accessible from:: 31. 12. 2999

Thesis defence

• Supervisor: RNDr. Oldřich Benada, CSc.

JAN EVANGELISTA PURKYNĚ UNIVERSITY IN ÚSTÍ NAD LABEM

Faculty of Science

Bachelor programme / field:
Biology / Biology