Bc. Adam Krejčí, Ph.D.

Master's thesis

Návrh a implementace analýzy sekvenačních dat pro detekci proteinových interakcí

Analysis of sequencing data for prediction of protein interactions
Abstract:
Cílem práce bylo navrhnout vhodný postup pro analýzu velkého množství dat popisujících biologické sekvence získané metodou Phage display, který bude schopen v datech identifikovat jednotlivé protein-proteinové interakce, dále vytvořit základní implementaci zvoleného postupu a prověřit jeho schopnosti zpracovat data reálného rozsahu. Byl navržen postup kombinující hierarchické shlukování v upravené …more
Abstract:
The aim of this thesis was to develop suitable method of analysing large amounts of data describing biological sequences acquired by the Phage display method. The process should identify particular protein-protein interactions. Next point was to create basic implementation of this method and test its ability to process real-sized data. Presented method is a combination of adjusted hierarchical clustering …more
 

Keywords

Protein Phage display bakteriofág Sekvenování DNA nové generace Shluková analýza skrytý Markovův model
 
Language used: Czech
Date on which the thesis was submitted / produced: 22. 5. 2013
Identifier: https://is.muni.cz/th/s3gpk/

Thesis defence

  • Date of defence: 26. 6. 2013
  • Supervisor: Ing. Matej Lexa, Ph.D.
  • Reader: Mgr. Vojtěch Bystrý, Ph.D.

Citation record

Cite this text

Full text of thesis

Contents of on-line thesis archive
Published in Theses:
  • světu
Other ways of accessing the text
Institution archiving the thesis and making it accessible: Masarykova univerzita, Fakulta informatiky
Složka Reference to the local database directory of the institution