Efektivní výpočty a vizualizace korelací v medicínských signálech

Bc. David Němeček

Master's thesis

Efficient computation and visualization of correlations in medical signals

Anotácia:

Práce vychází z požadavků výpočetních neurověd prozkoumat funkční mapování mozku. Se zaměřením na metody měření nervové aktivity iEEG a fMRI se zabývá hledáním funkční konektivity struktur mozku přes výpočty korelací signálů. Pro tento účel předkládá nově vytvořený nástroj pro efektivní výpočet korelací s velký objemem vstupních dat. Program je postaven na základě paralelního algoritmu s využitím standardu MPI. Dále se práce věnuje tvorbě vizualizačního programového rámce určeného k práci s uvedenými medicínskými daty a jejich korelacemi.

Abstract:

Thesis is based upon the requirements of computational neurosciences to examine functional brain mapping. Using neural activity measurement methods iEEG and fMRI we are using time series correlation computations to determine functional connectivity of brain structures. For this purpose we have devised a new program for efficient correlation computations of large input data. The program is based on a parallel algorithm utilizing the MPI standard. Following is a description of a visualization framework designed specifically for previously described medical data and corresponding correlations.

Kľúčové slová

neurověda, funkční konektivita, iEEG, fMRI, korelace, vzájemná korelace, koherence, vizualizace dat, paralelizace, zpracování signálu

Jazyk práce: Czech

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 23. 5. 2013

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 28. 6. 2013
• Vedúci: Mgr. Aleš Křenek, Ph.D.
• Oponent: RNDr. Jan Fousek

Masaryk University

Faculty of Informatics

Master programme / odbor:
Informatics / Parallel and Distributed Systems