Využití qPCR pro detekci mutací

Bc. Aneta MRÓZKOVÁ

Diplomová práce

Using qPCR for mutation detection

Anotace:

Tato diplomová práce je zaměřena na možnost využití kvantitativní polymerázové řetězové reakce a analýzy křivek tání s vysokým rozlišením pro detekci mutací a jednonukleotidových polymorfismů DNA. Ve vzorcích DNA byly detekovány jednonukleotidové záměny A>G a A>C, v místech nasedání primerů T7 a/nebo SK. Pomocí systému LightCycler 480 byly provedeny HRM testy, zahrnující analýzy křivek tání a skenování mutací. Byla prokázána závislost hodnoty Cq na procentuálním zastoupení mutací ve vzorku a rozlišeny tranzice a transverse.

Abstract:

This thesis is focused on the possibility of using quantitative polymerase chain reaction and high-resolution melting curve analysis for detection of mutations and single nucleotide polymorphisms in DNA. Single nucleotide changes A> G and A> C in the regions for annealing of the primers T7 and/or SK in DNA samples were detected. HRM assays were performed using LightCycler 480 system. These assays include the analysis of melting curves and mutation scanning. Dependence of Cq values for the percentage of mutations in the sample was demnonstrated and transitions and transversions were dinstinguished.

Klíčová slova

real-time polymerázová řetězová reakce (qPCR), mutace, HRM, jednonukleotidový polymorfismus (SNP)

Jazyk práce: čeština

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 27. 4. 2015

Zveřejnit od: 27. 4. 2015

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 19. 5. 2015
• Vedoucí: Mgr. Jiří Červeň

OSTRAVSKÁ UNIVERZITA V OSTRAVĚ

Přírodovědecká fakulta

Magisterský studijní program / obor:
Biologie / Experimentální biologie