Návrh struktur vybraných makromolekul metodami výpočetní chemie – Bc. Jan PAUSWANG
Bc. Jan PAUSWANG
Diplomová práce
Návrh struktur vybraných makromolekul metodami výpočetní chemie
Design of macromolecular structures using computational methods
Anotace:
Práce se zabývá vytvořením modelů polymerázy cytomegaloviru. Při vytváření modelu byl pro návrh struktury použit program I-TASSER. Simulace modelů probíhaly pomocí výpočtů založených na principech molekulové mechaniky v programu Amber. Templáty, na jejichž základě byly pomocí programu I-TASSER vytvořeny modely polymerázy, odpovídaly kódům 2gv9, 3iay a 4flw v PDB databázi. Byly vytvořeny dva modely …víceAbstract:
In this work the generating of model of polymerase of cytomegalovirus was studied. I-TASSER program was used to prediction of polymerase structure. Simulation of models were performed with program Amber using molecular mechanism principles. Structure of models is based on concrete structures of herpesvirus polymerase (2gv9), yeast (3iay) and archaebacteria (4flw). Models were prepared with DNA in two …více
Jazyk práce: čeština
Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 4. 5. 2018
Obhajoba závěrečné práce
- Vedoucí: Mgr. Petra Kührová, Ph.D.
Citační záznam
Jak správně citovat práci
PAUSWANG, Jan. Návrh struktur vybraných makromolekul metodami výpočetní chemie. Olomouc, 2018. diplomová práce (Mgr.). UNIVERZITA PALACKÉHO V OLOMOUCI. Přírodovědecká fakulta
Plný text práce
Obsah online archivu závěrečné práce
Zveřejněno v Theses:- světu
Jak jinak získat přístup k textu
Instituce archivující a zpřístupňující práci: UNIVERZITA PALACKÉHO V OLOMOUCI, Přírodovědecká fakultaUNIVERZITA PALACKÉHO V OLOMOUCI
Přírodovědecká fakultaMagisterský studijní program / obor:
Chemie / Materiálová chemie
Práce na příbuzné téma
-
Předpověď stability proteinů pomocí kombinace strojového učení a molekulové mechaniky
Elkhan Malmanov -
Studium stability uhlíkových teček metodami molekulové mechaniky
Michal LANGER -
Studium komplexů proteinů metodami molekulového modelování
Veronika Lásková -
Studium konformačního chování amyloidu beta a jeho mutantů v pozici 35 metodami molekulového modelování
Libuše Dvořáková -
Studium molekulových interakcí v nukleových kyselinách: (deoxy)ribosa-báze a fosfát-báze
Klaudia Mráziková -
Studium molekulových interakcí v L1 ribosomálním stalku
Miroslav Krepl
Název
Vložil
Vloženo
Práva