Strukturní změny v regulačních oblastech protoonkogenů a nádorových supresorů.

Zuzana KUCHÁROVÁ

Bachelor's thesis

Structural changes in the regulation regions of protooncogenes and tumour suppressors.

Anotácia:

Protoonkogeny a nádorové supresory jsou důležitými regulačními geny, jejichž produkty se zapojují v regulaci buněčného cyklu. Narušení regulace exprese protoonkogenů a nádorových supresorů může vést k neoplastickým změnám buněk a nádorovému bujení. Bylo zaznamenáno, že kromě regulačních proteinů se do regulace genové exprese mohou zapojovat i zvláštní struktury DNA vymykající se běžnému B-šroubovicovému vinutí ? například levotočivá Z-DNA, křížové formy DNA, triplexové formy DNA a nebo G-kvadruplexové struktury. Výzkumy naznačují, že tyto alternativní struktury mohou ovlivňovat organizaci chromatinu, mohou být rozpoznávány transkripčními faktory nebo naopak mohou vazbě transkripčích faktorů bránit. Jakákoli mutace v sekvenci s potenciálem tvorby alternativní struktury DNA může vést k neschopnosti přeměny B-DNA do jiné podoby a k narušení regulace cílových genů. Sekvence s potenciálem ke tvorbě alternativní struktury DNA bývají často nalézány v regulačních oblastech mnoha genů včetně protooknogenů. Nádorové supresory zřejmě využívají jiné mechanismy regulace. Struktury lišící se od B-DNA v jejich regulačních oblastech nebývají nalézány, i když sekvence s potenciálem k jejich tvorbě jsou v celém genomu rozloženy pravidelně, a to i v nádorových supresorech. Deregulaci nádorových supresorů často způsobují hypermetylace v promotorových CpG ostrůvcích.

Abstract:

Proto-oncogenes and tumour suppressors are important regulation genes. Their products are involved into the regulation of the cell cycle. It can lead to neoplastic changes of cells, if the regulation of expression of proto-oncogenes or tumour suppressors is disturbed. It has been observed, that not only regulation proteins but also special structures of non-B-DNA ? that include left-handed Z-DNA, cruciforms, triplexes and G-quadruplexes ? can participate in the regulation of gene expression. These alternative structures can affect chromatin organization, they are recognized with trasncriptional factors, conversly they can prevent DNA from binding proteins. Any mutation in a sequence with the ability to form the alternative structure of DNA can lead to an inability to transform this alternative structure and to deregulate target genes. Sequences that are able to create alternative structures of DNA are often located in regulation regions of many genes including proto-oncogenes. Apparently, tumour suppressors use different regulation mechanisms, because there are no observations of non-B-DNA structures in regulation regions of these genes, even if the seqences with potential of formation from clasic B-DNA are constantly located as in all genes as in tumour suppressors. The deregulation of tumour suppressor genes is often caused by hypermethylation in promoter CpG islands

Kľúčové slová

regulační oblast genů, protoonkogen, nádorový supresor, alternativní struktury DNA, křížová forma DNA, Z-DNA, G-kvadruplex, H-DNA, hypermetylace

Jazyk práce: Czech

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 23. 4. 2014

Zverejniť od: 23. 4. 2014

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 19. 5. 2014
• Vedúci: RNDr. Petr Pečinka, Ph.D.

University of Ostrava

Faculty of Science

Bachelor programme / odbor:
Biology / Experimental Biology