Epidemiologický model SIR - SARS-CoV-2 v České republice

Jiří Brejcha

Bakalářská práce

SIR epidemic model - SARS-CoV-2 in Czechia

Anotace:

Tématem bakalářské práce je použití systémové dynamiky pro vytvoření funkčního epidemiologického modelu pandemie SARS-CoV-2 v České republice. V teoretické části se práce zaobírá vznikem a vývojem systémového myšlení. Jsou v ní vysvětleny i základy epidemiologie a kompartmentových modelů. Především modelu SIR a jeho variant. V praktické části práce je popsána konstrukce základní struktury smyčkového diagramu. Z jehož základů vychází posléze vytvořený diagram stavů a toků. Diagramy jsou konstruovány v programu Vensim. Ve kterém jsou i prováděny následné simulace. Podkladem pro model jsou data zveřejněná Ministerstvem zdravotnictví České republiky. Po kalibraci modelu a jeho následné validaci budou simulovány alternativní scénáře za účelem nalezení, co nejefektivnějšího balíku opatření pro jednotlivé vlny epidemie.

Abstract:

The topic of the bachelor thesis is the use of system dynamics to create a functional epidemiological model of the SARS-CoV-2 pandemic in the Czech Republic. The theoretical part of the thesis deals with the origin and development of systems thinking. It also explains the basics of epidemiology and compartmental models. Especially the SIR model and its variants. The practical part of the thesis describes the construction of the basic structure of the loop diagram. From the foundations of which the subsequently created state and flow diagram is based. The diagrams are constructed in the Vensim program. In which the subsequent simulations are performed. The basis for the model is data published by the Ministry of Health of the Czech Republic. After calibration of the model and its subsequent validation, alternative scenarios will be simulated in order to find the most effective package of restrictions for each wave of the epidemic.

Klíčová slova

počítačová simulace, SIR, SEIR, zpětnovazební smyčka, epidemiologický model, diagram stavů a toků, příčinně smyčkový diagram, Systémová dynamika

Keywords

stock and flow diagram, causal loop diagram, System dynamics, computer simulation, SIR, SEIR, feedback loop, epidemiological model

Jazyk práce: čeština

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 19. 3. 2023

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 15. 5. 2023
• Vedoucí: doc. Ing. Igor Krejčí, Ph.D.
• Oponent: Anna Selivanova, Ing. Bc.

Česká zemědělská univerzita v Praze

Provozně ekonomická fakulta

Bakalářský studijní program:
Informatika