Optimalizace rychlé molekulárně genetické metody k detekci mutací v nádorové populaci buněk

Klára Pížová

Diplomová práce

Optimalization of the fast molecular genetics method for detection of mutations in tumor cell population

Anotace:

Gen KRAS (homolog onkogenu Kirsten rat sarcoma viru) kóduje protein p21 zapojený do signálních kaskád v buňce. Protein p21 je tedy jedním z klíčových prvků regulujících buněčné dělení a diferenciaci. Mutace v jeho genu, zejména bodové mutace ve 12. a 13. kodonu 1. exonu, se velmi často vyskytují v souvislosti s nádorovým onemocněním u lidí a mají významný dopad nejen na závažnost onemocnění, ale také na účinnost léčby. Cílem teoretické části diplomové práce bylo shrnout dostupné poznatky o genu KRAS, o významu jeho proteinového produktu, zejména v souvislosti se vznikem nádorového onemocnění, a také o dostupných molekulárně genetických metodách detekce mutací v genu KRAS. Cílem experimentální části diplomové práce bylo navrhnout nejvhodnější postup a podmínky PCR metody pro detekci sedmi nejčastějších bodových mutací genu KRAS ve 12. a 13. kodonu 1. exonu: Gly12Asp (GGT>GAT), Gly12Ala (GGT>GCT), Gly12Val (GGT>GTT), Gly12Ser (GGT>AGT), Gly12Arg (GGT>CGT), Gly12Cys (GGT>TGT) a Gly13Asp (GGC>GAC)

Abstract:

KRAS gene (Kirsten rat sarcoma viral oncogene homolog) codes p21 that is involved in cell signalling cascade and so that is key regulator of cell division and differentiation. Mutations in this gene, especially point mutation in 12th and 13th codon of 1st exon, are frequently associated with human tumour diseases and have significant impact on seriousness of diseases as well as treatment efficiency. Aim of theoretical part of diploma thesis was to summarize knowledge about KRAS gene, importance of its protein product, especially in connection with tumour disease formation and to ellucidate use of molecular and genetic methods to detect mutation in KRAS gene. Goal of experimental part of diploma thesis was to find the most suitable procedure and conditions for PCR method focused on detection of the seven most frequently point mutation in gene KRAS in 12th and 13th codon of 1st exon: Gly12Asp (GGT>GAT), Gly12Ala (GGT>GCT), Gly12Val (GGT>GTT), Gly12Ser (GGT>AGT), Gly12Arg (GGT>CGT), Gly12Cys (GGT>TGT) and Gly13Asp (GGC>GAC)

Klíčová slova

KRAS, rakovina, ARMS

Keywords

KRAS, cancer, ARMS

Jazyk práce: čeština

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 12. 5. 2010

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 8. 6. 2010
• Vedoucí: Jiří Drábek
• Oponent: Jozef Škarda

Univerzita Palackého

Přírodovědecká fakulta

Magisterský studijní program / obor:
Biologie / Molekulární a buněčná biologie