Epigenetická regulace rostlinných transpozonů

Bc. Klára Kočanová

Bachelor's thesis

Epigenetic regulation of plant transposable elements

Anotácia:

V této bakalářské práci se věnuji transponovatelným elementům, jedná se o úseky DNA se schopností transpozice. Rozdělují se do dvou tříd podle mechanismu přesunu. Do první třídy se řadí retrotranspozony využívající k transpozici reverzní transkriptázu, do třídy druhé patří DNA transpozony měnící polohu pomocí enzymu transponázy. Svým přesunem mohou tyto elementy způsobit narušení genové exprese, proto byly vytvořeny epigenetické mechanismy, které transpozony umlčují. Jedná se o procesy posttranskripční, kam se řadí interference RNA, a transkripční, v tomto případě se jedná o modifikaci histonů a metylaci DNA. Dalším procesem spojeným s transpozony je jejich domestikace hostitelským genomem. V této práci popisuji klasifikaci transponovatelných elementů, epigenetické mechanismy vedoucí k jejich umlčení a v poslední části se věnuji jednotlivým případům domestikace těchto mobilních elementů.

Abstract:

This bachelor’s thesis focuses on transposable elements, which are DNA segments with transposition ability. They are divided into two classes according to the transposition process. The first class includes retrotransposons using reverse transcriptase for transposition, the second class includes DNA transposons transponating with transposase enzyme. These elements can cause disruption of gene expression by moving into coding DNA. Epigenetic mechanisms have been created to silence transposons. There are posttranscriptional processes involving RNA interference, and transcriptional, in this case histone modification and DNA methylation. Another process, connected with transposons, is their domestication by the host genome. In this work I describe the classification of the transposable

Kľúčové slová

Epigenetika, Transpozony, Domestikace, Metylace DNA, interference RNA

Jazyk práce: Czech

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 10. 5. 2019

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 11. 6. 2019
• Vedúci: Mgr. Zdeněk Kubát, Ph.D.
• Oponent: Mgr. Vratislav Peška, Ph.D.

Masaryk University

Faculty of Science

Bachelor programme / odbor:
Experimental Biology / Molecular Biology and Genetics