Funkční analýza promotorových oblastí Treponema pallidum subsp. pallidum: krok k poznání mechanismů patogeneze

Bc. Petra Dobšáková

Master's thesis

Functional analysis of Treponema pallidum subsp.pallidum a step towards understanding of syphilis pathogenesis

Anotácia:

Treponema pallidum je původcem venerického onemocnění syfilis. Díky své schopnosti unikat imunitnímu systému bývá označována za neviditelného patogena. Dodnes není znám mechanismus vzniku infekce. Nové světlo by měl přinést popis genové exprese. T. pallidum se nedá kultivovat in vitro, pro studium treponemálních promotorů byla využita Escherichia coli. Fragmenty treponemální DNA byly vkládány do plazmidového vektoru pCS26. Byla vytvořena knihovna promotorů čítající 6080 klonů. Měření luminiscence poskytlo spolehlivé informace o přítomnosti a síle promotoru. Většina nalezených promotorových sekvencí se nacházela uvnitř genu. Pravděpodobně se jedná o alternativní promotory nebo promotory pro antisense RNA. Expresi genů u T. pallidum zřejmě řídí řada různých mechanismů.

Abstract:

Treponema pallidum is the causative agent of syphilis. It is known as a shealth pathogen for its ability to avoid immune response. The mechanism of pathogenesis is still unknown. Description of gene expression should shed the new light. T. pallidum can not be cultured in vitro. Escherichia coli was exploited to study treponemal promoters. Fragments of treponemal DNA were inserted to plasmid vector pCS26. The library of promoters numbering 6080 clones was created. Measurement of luminiscence provided reliable information about the presence and strength of promoter. Majority of promoter sequences are located within the gene. These promoters are probably alternative promoters or promoters for antisense RNA. Gene expression in T. pallidum is apparently governed by number of different mechanisms.

Kľúčové slová

Treponema pallidum, syfilis, promotor, genová exprese, RNA polymeráza, sigma faktor, syphilis, promoter, gene expression, RNA polymerase, sigma factor

Jazyk práce: Czech

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 12. 5. 2015

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 4. 6. 2015
• Vedúci: prof. MUDr. David Šmajs, Ph.D.

Masaryk University

Faculty of Science

Master programme / odbor:
Experimental Biology / Molecular Biology and Genetics