Acceleration of image processing algorithms for single particle analysis by electron microscopy – Mgr. David Střelák
Mgr. David Střelák
Advanced ('rigorózní') thesis
Acceleration of image processing algorithms for single particle analysis by electron microscopy
Acceleration of image processing algorithms for single particle analysis by electron microscopy
Anotácia:
Kryogenní Elektronová Mikroskopie (Cryo-EM) je důležitá oblast současné strukturální biologie. Moderní elektronové mikroskopy produkují během relace terabajty dat, která se následně zpracovávají několik dní. K tomu, abychom získali rekonstruovanou částici v téměř atomárním rozlišení, potřebujeme zpracovat stovky tisíc projekcí. Cílem těchto tezí je vylepšit algoritmy používané v Cryo-EM, především …viacAbstract:
Cryogenic Electron Microscopy (Cryo-EM) is a very important field in the current structural biology. Modern electron microscopes can produce terabytes of data per single session, which takes days to process. Typically, hundreds of thousands of particles need to be used during the 3D refinement to obtain a near-atomic resolution. The goal of this thesis proposal is to improve the algorithms used in …viac
Jazyk práce: English
Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 20. 2. 2020
Identifikátor:
https://is.muni.cz/th/tt7i8/
Obhajoba závěrečné práce
- Obhajoba proběhla 27. 5. 2020
- Oponent: doc. Ing. Jiří Jaroš, Ph.D., Jose-Jesus Fernandez, PhD
Citační záznam
Plný text práce
Obsah online archivu závěrečné práce
Zveřejněno v Theses:- světu
Jak jinak získat přístup k textu
Instituce archivující a zpřístupňující práci: Masarykova univerzita, Fakulta informatikyMasaryk University
Faculty of InformaticsAdvanced ('rigorózní řízení') programme / odbor:
Computer systems, communication and security / Computer systems, communication and security
Práce na příbuzné téma
-
Optimization of JVM settings for application performance
Josef Pavelec -
Autotuning OpenCL implementace výpočtu mapy elektrostatického potenciálu
Filip Petrovič -
Acceleration of image processing algorithms for single particle analysis by electron microscopy
David Střelák -
Přenos velkého množství dat v prostředí HPC
Vítězslav Kaňok -
Metody komprese bioinformatických dat pro přenos na HPC infrastrukturu
Vojtěch Moravec -
Analýza betonových základových konstrukcí pomocí superpočítače a HPC
Zdeňka Neuwirthová -
Možnosti monitoringu a optimalizace HPC clusterů s GPU kartami
Tomáš Huťa -
Grafové knižnice pre HPC
Viliam Majerčík