Zjemnění Delaunayovy triangulace molekulárních struktur – Bc. Pavel Němec
Bc. Pavel Němec
Diplomová práce
Zjemnění Delaunayovy triangulace molekulárních struktur
Refinement of Delaunay Triangulation of Molecular Structures
Anotace:
Tato práce se zabývá algoritmy pro analýzu proteinových struktur, jež mají uplatnění především při vývoji nových léků. Konkrétně se práce věnuje metodám pro výpočet proteinových tunelů založených na principu Delaunay triangulace a míře znepřesnění, kterou se aplikací těchto metod dopouštíme. Tento typ algoritmů totiž implicitně předpokládá, že velikosti všech atomů v molekule jsou si rovny. Navrženy …víceAbstract:
This thesis is about algorithms for analyzing protein structure which is useful especially for medical purposes. This thesis is focusing especially on methods for finding tunnels in proteins based on Deluanay triangulation. The main problem of this kind of methods is assumption that all atoms are the same size. In this thesis there are designed two methods for extension of Deluanay triangulation so …více
Jazyk práce: čeština
Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 28. 5. 2012
Identifikátor:
https://is.muni.cz/th/zccti/
Obhajoba závěrečné práce
- Obhajoba proběhla 26. 6. 2012
- Vedoucí: RNDr. David Sehnal, Ph.D.
- Oponent: doc. RNDr. David Svoboda, Ph.D.
Plný text práce
Obsah online archivu závěrečné práce
Zveřejněno v Theses:- světu
Jak jinak získat přístup k textu
Instituce archivující a zpřístupňující práci: Masarykova univerzita, Fakulta informatikyMasarykova univerzita
Fakulta informatikyMagisterský studijní program / obor:
Aplikovaná informatika / Aplikovaná informatika
Práce na příbuzné téma
-
Tunely v proteinech – analýza dostupných informací
Šimon Dobias -
Detekce kolizí mezi proteiny
Filip Andres -
Systém na integraci bioinformatických nástrojů pro analýzu tunelů v proteinech
Jan Štourač -
Metody pro identifikaci biologicky relevantních tunelů v proteinech
Ondřej Vávra -
Automatický doking ligandu do tunelu v proteinu
Jan Plhák -
Studium a inženýrství tunelů v proteinech
Robin Nemeth -
Detekce asymetrických tunelů v proteinech pomocí Voroného diagramu
Jakub Vallo