Výskyt bakterií rodu Aeromonas v technologicky \nl{}neupravených zdrojích pitných vod

Bc. Šárka Martinková

Master's thesis

The occurrence of Aeromonas in technology untreated sources of drinking water

Abstract:

Práce je zaměřena na výskyt bakterií rodu Aeromonas v technologicky neupravených zdrojích pitných vod. Celkem bylo zpracováno 40 vzorků vod odebraných v různých místech České republiky, přičemţ u kaţdého vzorku byl stanovován počet bakterii rodu Aeromonas ve srovnání s kráceným mikrobiologickým rozborem, který zahrnoval stanovení celkových počtů mikroorganismů při 22 °C a 36 °C, počtu enterokoků, koliformních bakterií a E. coli klasickými kultivačními technikami. Bylo analyzováno 23 vzorků vod ze studen a 17 vzorků vod z přírodních studánek. U vzorků studničních vod byl zaznamenán výskyt 0,08 % enterokoků, 3,89 % koliformních bakterií, 0,06 % E. coli a 3,49 % aeromonád, zatímco ve studánkách bylo stanoveno 0,07 % enterokoků, 13,39 % koliformních bakterií, 0,33 % E. coli a 11,25 % aeromonád. Dále byla optimalizována metoda real-time PCR pro stanovení bakterií rodu Aeromonas přímo ve vzorcích vod. U 5 vybraných vzorků vod bylo provedeno porovnávání dvou komerčně dodávaných kitů pro real-time PCR - SYBR? Green JumpStartTM Taq ReadyMixTM a KAPA SYBR? fast qPCR kit. Výsledky získané metodou real-time PCR byly porovnány s výsledky získanými klasickými kultivačními technikami.

Abstract:

This work is focused on demonstrating the presence of Aeromonas genus in technological raw drinking water supply. A 40 water samples from different region of the Czech Republic were compiled. An Aeromonas genus in comparison with reduced microbiological analysis of each water sample was determined. A heterothropic plate count at 22 °C as well as at 36 °C together with number of enterococci, coliform bacteria and E. coli using classical cultivation techniques were defined. 23 well water compared to 17 natural spring water samples were analyzed which resulted in the presence of 0.08 % of enterococci, 3.89 % of coliform bacteria, 0.06 % of E. coli and 3.49 % of Aeromonas genus for studied well water. On contrary in collected natural spring samples 0.07 % of enterococci, 13.39 % of coliform bacteria, 0.33 % of E. coli and 11.25 % Aeromonas genus were observed. It was optimized method real-time PCR for detection Aeromonas genus directly in water samples. For 5 selected water samples were performed comparing two commercially available kits for real-time PCR - SYBR? Green JumpStartTM Taq ReadyMixTM and KAPA SYBR? fast qPCR kit. The results obtained by method real-time PCR were compared with results obtaining using classical cultivation techniques.

Keywords

Aeromonas, pitná voda, real-time PCR, koliformní bakterie

Language used: Czech

Date on which the thesis was submitted / produced: 12. 5. 2014

Thesis defence

• Date of defence: 2. 6. 2014
• Supervisor: Ing. Marcela Pejchalová, Ph.D.

University of Pardubice

Faculty of Chemical Technology

Master programme / field:
Chemistry and Technology of Foodstuffs / Evaluation and Analysis of Foodstuffs