Detekce a identifikace virů pomocí sekvenování nové generace (NGS) – Bc. Kateřina PODRÁBSKÁ
Bc. Kateřina PODRÁBSKÁ
Master's thesis
Detekce a identifikace virů pomocí sekvenování nové generace (NGS)
Abstract:
Sekvenování nové generace je moderní metoda aplikovaná v rostlinné virologii k citlivé detekci již charakterizovaných a nových patogenů bez jejich jakékoliv předešlé znalosti.V této studii byly detekovány tři nové a dva již popsané viry de-novo skládáním single- end čtení z NGS Illumina (Hi-Seq 2500 systém) z celkové poly(A) obohacené RNA nemocného jetele lučního (Trifolium pratense) a indikátorové …moreAbstract:
Next generation sequencing is a modern method applied in plant virology for sensitive detection of previously characterized and novel pathogens without any preceding knowledge of them. In this study three novel and two already described viruses were detected by de novo assembly of Illumina single-end reads ( Hi-Seq 2500 system) from total poly(A) enriched RNA of diseased red clover (Trifolium pratense …more
Language used: Czech
Date on which the thesis was submitted / produced: 19. 4. 2017
Thesis defence
- Supervisor: Dr. Ing. Jana Fránová
Citation record
ISO 690-compliant citation record:
PODRÁBSKÁ, Kateřina. \textit{Detekce a identifikace virů pomocí sekvenování nové generace (NGS)}. Online. Master's thesis. České Budějovice: University of South Bohemia in České Budějovice, Faculty of Science. 2017. Available from: https://theses.cz/id/c47w3k/.
The right form of listing the thesis as a source quoted
PODRÁBSKÁ, Kateřina. Detekce a identifikace virů pomocí sekvenování nové generace (NGS). Č. Budějovice, 2017. diplomová práce (Mgr.). JIHOČESKÁ UNIVERZITA V ČESKÝCH BUDĚJOVICÍCH. Přírodovědecká fakulta
Full text of thesis
Contents of on-line thesis archive
Published in Theses:- světu
Other ways of accessing the text
Institution archiving the thesis and making it accessible: JIHOČESKÁ UNIVERZITA V ČESKÝCH BUDĚJOVICÍCH, Přírodovědecká fakultaUNIVERSITY OF SOUTH BOHEMIA IN ČESKÉ BUDĚJOVICE
Faculty of ScienceMaster programme / field:
Biology / Experimental Biology
Theses on a related topic
-
Využití bakteriofágů v rychlé a účinné diagnostice mykobakterií
Monika Beinhauerová -
Identifikace probiotických baktérií pomocí metody PCR v potravinových fermentovaných výrobcích rostlinného původu
Tereza Kuljovská -
Vývoj metody superkritické fluidní chromatografie ve spojení s tandemovou hmotnostní spektrometrií pro analýzu kyselých fytohormonů v rostlinném materiálu
Kateřina SMOLKOVÁ -
Stanovení obsahu silic různými metodami v rostlinných matricích
Jolana Chytková -
Optimalizace multidetekční metody pro analýzu reziduí pesticidů v rostlinných materiálech
Dana Hájková -
Nové metody v ošetření semen ke zvýšení klíčivosti
Barbora Tunklová -
Analýza těžkých kovů v rostlinné matrici metodou LIBS
Marek Opluštil -
Analýza patogenních genetických variant u dětí s mentálními retardacemi pomocí metod komparativní genomové hybridizace na mikročipech (array-CGH) a sekvenování "nové generace" (NGS)
Markéta Wayhelová
Name
Posted by
Uploaded/Created
Rights