Analýza smíšených kultur hub a bakterií optickou a fluorescenční mikroskopií

Bc. Lucie IHELKOVÁ

Master's thesis

Analysis of mixed cultures of fungi and bacteria by optical and fluorescence microscopy

Anotácia:

Houby bílé hniloby jsou schopny degradovat širokou škálu organopolutantů díky extracelulárním ligninolytickým enzymům, které produkují. V přírodě se nejčastěji setkáváme s vícedruhovými biofilmy, proto současné studie zkoumají, zda dojde k ovlivnění biodegradační schopnosti hub za přítomnosti bakterií. Optická mikroskopie umožňuje nahlédnout do struktury biofilmu, fluorescenční mikroskopie doplní informace například o soužití mikroorganismů, životaschopnosti či enzymové aktivitě. Experimentální část diplomové práce byla zaměřena na analýzu smíšených kultur hub a bakterií optickou a fluorescenční mikroskopií. Fluorescenční sondy DAPI, Calcofluor white, LIVE/DEAD a MitoSOX Red splnily v experimentu svou danou funkci, zatímco použití fluorescenční sondy FUN1 nebylo úspěšné. Optická a fluorescenční mikroskopie představuje vhodnou doplňkovou metodu pro studium biodegradační schopnosti smíšených kultur hub a bakterií.

Abstract:

White rot fungi are able to degrade a wide range of organopolutants by the action of ligninolytic enzymes. In nature we most often find multispecies biofilms. Therefore, the present study focuses on the influence of the presence of bacteria on fungal biodegradation. Optical microscopy provides a view into the structure of the biofilm, fluorescence microscopy brings complex information about the coexistence of microorganisms, their viability and enzyme activities. Experimental part of the thesis was focused on the analysis of mixed cultures of fungi and bacteria by optical and fluorescence microscopy. Fluorescent probes DAPI, Calcofluor white, LIVE/DEAD and MitoSOX Red provided the expected results , while the use of fluorescent probe FUN1 wasn´t successful. Optical and fluorescence microscopy represent complementary methods for study of mixed cultures of fungi and bacteria.

Kľúčové slová

Fluorescenční mikroskopie, optická mikroskopie, DAPI, Calcofluor white, LIVE/DEAD, MitoSOX Red, biofilm, houby bílé hniloby, bakterie

Jazyk práce: Czech

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 27. 4. 2015

Zverejniť od: 27. 4. 2015

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 19. 5. 2015
• Vedúci: prof. RNDr. Kateřina Malachová, CSc.

University of Ostrava

Faculty of Science

Master programme / odbor:
Biology / Systematic Biology and Ecology