Srovnání výskytu cyklomodulinů a mikrobiálního složení ze stolice zdravých jedinců a pacientů s kolorektálním karcinomem

Bc. Markéta Lipovská

Bachelor's thesis

Comparison of the occurrence of cyclomodulins and microbial composition from the feces of healthy individuals and patients with colorectal carcinoma

Anotácia:

Jedním z nejčastěji diagnostikovaných nádorových onemocnění je kolorektální karcinom. Interakcí s imunitními buňkami nebo invazí do epiteliálních buněk se mohou bakterie střevního mikrobiomu podílet na rozvoji tohoto onemocnění. Mezi bakteriální toxiny ovlivňující vývoj nádorových onemocnění řadíme cyklomoduliny. Tato práce se zabývá porovnáním složení mikrobiomu a výskytu cyklomodulinových genů mezi pacienty s diagnostikovaným kolorektálním karcinomem a skupinou zdravých jedinců. Součástí práce je zpracování dat v programovacím jazyku R, testování pomocí několika statistických testů, grafická vizualizace výsledků a vyhodnocení vůči teoretickým předpokladům.

Abstract:

One of the most frequently diagnosed cancerous diseases is colorectal carcinoma. By interacting with immune cells or invading epithelial cells, gut microbiome bacteria may contribute to the development of this condition. Among the bacterial toxins influencing the development of cancerous diseases are cyclomodulins. This work focuses on comparing the microbiome composition and occurrence of cyclomodulin genes between patients diagnosed with colorectal carcinoma and a group of healthy individuals. The work includes data processing in the R programming language, testing using several statistical tests, graphical visualization of results, and evaluation against theoretical assumptions.

Kľúčové slová

Mikrobiom, Kolorektální karcinom, Cyklomoduliny, Software R, Analýza, Microbiome, Colorectal carcinoma, Cyclomodulins, Analysis

Jazyk práce: Czech

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 8. 8. 2023

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 5. 9. 2023
• Vedúci: Mgr. Lenka Kosečková Micenková, Ph.D.
• Oponent: Mgr. Kristýna Brodíková

Masaryk University

Faculty of Science

Bachelor programme / odbor:
Computational biology and biomedicine / Biomedical bioinformatics