Počítačová analýza struktury a vazebných míst lidské glykogen synthasy kinasy 3beta

Michaela Melíková

Bachelor's thesis

Computational Analysis of Human Glycogen Synthase Kinase 3beta Structure and Binding Sites

Anotácia:

Bakalářská práce se zaměřuje na počítačovou analýzu struktury lidské glykogen synthasy kinasy 3β (GSK-3β) s cílem lokalizovat a charakterizovat potenciální vazebná místa pro nové modulátory její aktivity. Tento enzym je kromě biosyntézy glykogenu zahrnut v řadě patologických procesů, jako je rakovina, diabetes mellitus II a Alzheimerova nemoc. Rozbor topochemických vlastností vazebných míst GSK-3β pomocí specializovaného softwaru poskytne poznatky pro racionální návrh nových selektivních léčiv na rakovinu či Alzheimerovu nemoc metodami strukturního virtuálního screeningu.

Abstract:

The bachelor thesis is focused on computational analysis of the structure of human glycogen synthase kinase 3β (GSK-3β) with the aim to localize and characterize potential binding sites for novel modulators of its activity. Apart from glycogen biosynthesis, the enzyme is involved in an array of pathological processes, like cancer, diabetes mellitus type II and Alzheimer's disease. The study of topochemical characteristics of GSK-3β binding sites using specialized software will yield findings for a rational design of the new selective molecules for cancer or Alzheimer's disease by the means of virtual screening.

Kľúčové slová

glykogen synthasa kinasa 3β, analýza počítačová, vazebná místa, dokování

Keywords

glycogen synthase kinase 3β, computational analysis, binding sites, docking

Jazyk práce: English

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 20. 5. 2016

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 13. 6. 2016
• Vedúci: Mgr. et Mgr. Rafael Doležal, Ph.D.
• Oponent: PharmDr. Michal Novotný, Ph.D.

University of Hradec Králové

Faculty of Science

Bachelor programme / odbor:
Chemie / Chemie