Molekulární simulace DNA-oligonukleotidu modifikovaného protinádorovým komplexem oxaliplatina, podložené strukturálními daty získanými pomocí NMR – Bc. Anna Vavreková
Bc. Anna Vavreková
Bachelor's thesis
Molekulární simulace DNA-oligonukleotidu modifikovaného protinádorovým komplexem oxaliplatina, podložené strukturálními daty získanými pomocí NMR
Molecular simulations of a DNA oligonucleotide modified by the antitumor drug oxaliplatin, exploiting structural data from an NMR-study
Abstract:
The aim of this bachelor thesis has been to find molecular structure of DNA-oligonucleotide modified by anticancer complex oxaliplatin using one of the computational chemistry methods - molecular dynamics, exploiting structural data from an NMR-study. We have compared our model with other published oxaliplatin-DNA and cisplatin-DNA structural models, to find out how much they differ. As a result, compared …moreAbstract:
Cieľom tejto bakalárskej práce bolo pomocou počítačových simulácií DNA-oligonukleotidu modifikovaného protinádorovým komplexom oxaliplatina stanoviť jeho zodpovedajúcu molekulovú štruktúru na základe štrukturálnych dát nameraných NMR spektroskopiou s využitím výpočtových metód molekulovej dynamiky. Takto získanú štruktúru sme porovnali s inými publikovanými komplexmi oxaliplatina-DNA a cisplatina-DNA …more
Language used: Slovak
Date on which the thesis was submitted / produced: 27. 1. 2016
Identifier:
https://is.muni.cz/th/vutv3/
Thesis defence
- Date of defence: 18. 2. 2016
- Supervisor: prof. Dr. Jiří Kozelka, PhD.
Citation record
ISO 690-compliant citation record:
VAVREKOVÁ, Anna. \textit{Molekulární simulace DNA-oligonukleotidu modifikovaného protinádorovým komplexem oxaliplatina, podložené strukturálními daty získanými pomocí NMR}. Online. Bachelor's thesis. Brno: Masaryk University, Faculty of Science. 2016. Available from: https://theses.cz/id/du7ain/.
Full text of thesis
Contents of on-line thesis archive
Published in Theses:- světu
Other ways of accessing the text
Institution archiving the thesis and making it accessible: Masarykova univerzita, Přírodovědecká fakultaMasaryk University
Faculty of ScienceBachelor programme / field:
Chemistry / Biophysical Chemistry
Theses on a related topic
-
Strukturní analýza proteinů 14-3-3 s využitím molekulové dynamiky.
Hana Zigová -
Molekulová dynamika a výpočty volných energii mono a di-nukleotidových analogů s potenciálním antibiotickým účinkem
Hana Zigová -
Struktura a dynamika nukleových kyselin
Viktor Illík -
Struktura glykosyltransferázy toxinu TcdB s nativním substrátem
Náth Vozábal -
Strukturní dynamika biomolekulárních komplexů
Pavlína Pokorná -
Studium interakcí iontů s hyaluronanem metodou molekulové dynamiky (virtuální experiment)
Václav Buš -
Struktura kratkého telomerického přesahu z S. cerevisiae
Martin Gajarský -
Výpočet profilů Gibbsovy energie chemické reakce pomocí ab initio molekulové dynamiky kombinované s metodou Umbrella sampling
Pavel CHMELAŘ