Extrakce geometrických parametrů buněk ve 2-D obrazech z optické mikroskopie

Mgr. Pavlína Krečmerová

Bakalářská práce

Extraction of cells' geometrical parametres in 2-D images from optical microspcopy

Anotace:

Tato práce se zabývá metodami segmentace 2-D obrazů a jejich možným využitím při automatické analýze digitálních obrazů v rámci hematologické diagnostiky. Vedle teoretického rozboru dané problematiky je zde navržen algoritmus, který realizuje počítání buněk a měření jejich základních geometrických parametrů, jako je obvod, excentrita aj. v barevných digitálních 2-D obrazech hematologických preparátů. K tomuto účelu jsou použity techniky pro zlepšení kvality obrazu, morfologické operace a prahování. Praktickým výstupem předložené práce je program, který může zefektivnit jedno z mnoha laboratorních vyšetření na onemocnění dědičnou sférocytózou.

Abstract:

This work deals with 2-D image segmentation methods and their possible use in automatic analysis of digital images within haematological diagnostics. In addition to the theoretical analysis of the issue there is a proposed algoritm, which realizes counting cells and measuring their fundamental geometric parameters, such as perimeter, eccentricity and others in 2-D colour digital images of haematological preparations. Techniques for image quality improvement, morphological operations and thresholding are used for this purpose. Practical output of this thesis is a set of software tools, which can speed up one from many laboratorial investigation on heradity spherocytosis.

Klíčová slova

Zpracování a analýza obrazů, digitální mikroskopie, segmentace, prahování, binární obraz, erytrocyty, trombocyty, sférocytóza, entropie.

Jazyk práce: čeština

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 25. 5. 2009

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 17. 6. 2009
• Vedoucí: doc. Ing. Daniel Schwarz, Ph.D.
• Oponent: RNDr. Jiří Jarkovský, Ph.D.

Masarykova univerzita

Přírodovědecká fakulta

Bakalářský studijní program / obor:
Biologie / Matematická biologie