Specifické interakce uhlikových nanomateriálů s DNA

Mgr. Daniel Krafčík

Bakalářská práce

DNA interacting carbon nanomaterials

Abstract:

This work is aimed on studying interactions between selected carbon nanomaterial and the DNA sequences which were proven to have relation to biological function. DNA sequences represent the most significant structural motifs located in genome DNA. Nanomaterial is either carbon quantum dot with a negatively charged carboxyl group or carbon quantum dot with a positively charged ammonium group. One of the main aims of this work was to create a library of DNA motifs and demonstrate their utilization to find possible interaction partners. Polyacrylamide gel electrophoresis, CD spectroscopy, UV absorption spectroscopy and NMR spectroscopy were chosen to be tested for study of these interactions.

Abstract:

Tato práce se zabývá studiem interakcí mezi vybraným uhlíkovým nanomateriálem a DNA sekvencemi, u kterých byl prokázán jejich vztah k biologické funkci. Vybrané DNA sekvence zároveň reprezentují nejvýznamnější strukturní motivy nacházející se v genomové DNA. Nanomateriálem je buď uhlíková kvantová tečka se záporně nabitou karboxylovou skupinou, anebo s kladně nabitou amoniovou skupinou. Jedním z hlavních cílů této práce bylo vytvořit knihovnu DNA motivů a demonstrovat její použití pro vyhledání možných interakčních partnerů. Pro studium interakcí bylo testováno použití nativní polyakrylamidové gelové elektroforézy, CD spektroskopie, UV absorpční spektroskopie a NMR spektroskopie.

Klíčová slova

uhlíkový nanomateriál, uhlíková kvantová tečka, CD spektroskopie, DNA, kvadruplex, carbon nanomaterial, carbon quantum dot, CD spectroscopy, quadruplex

Jazyk práce: slovenština

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 21. 5. 2015

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 24. 6. 2015
• Vedoucí: doc. Mgr. Lukáš Trantírek, Ph.D.

Masarykova univerzita

Přírodovědecká fakulta

Bakalářský studijní program / obor:
Fyzika / Biofyzika