Význam mikroRNA v molekulární patologii renálního karcinomu

Bc. Jana Jančovičová

Bakalářská práce

Significance of microRNAs in molecular pathology of renal cell carcinoma

Abstract:

In our study, we collected group of 38 patients with localized or locally advanced clear-cell renal cell carcinoma (included 38 malignant tissue samples and 10 kidney tissue samples). We isolated miRNA in required quantity and quality. Using RT-PCR method we received expression levels of selected miRNA (miRNA-155, miRNA-141, miRNA-210, miRNA-200b, miRNA-200c, miRNA-106a, miRNA-106b, miRNA-182) in all 48 tissue samples. The expression levels of miRNA-155 (p<0,0001), miRNA-210 (p<0,0001), miRNA-106a (p<0,0001) and miRNA-106b (p<0,0001) were significantly over-expressed in tumor tissue samples, whereas the expression of miRNA-141 (p=0,002) and miRNA-200c (p<0,0001) were significant downregulated in malignant tissue samples. There is no significant differences between expression levels of miRNA-182 and miRNA-200b in tumor samples and kidney tissue samples. Our data suggest that miRNA-106b is an effective prognostic marker of time to progres in patients with ccRCC (Long-rank p=0,0324). We've confirmed some earlier observations performed on a smaller group of patients provided by miRNA microarray analysis. We were the first who identified prognostic significance of miRNA-106b which should be validated on a wider group of patiens.

Abstract:

Vytvorili sme súbor 38 pacientov s lokalizovaným alebo lokálne pokročilým svetlobunečným karcinómom (z nich 38 vzoriek tumoru, 10 vzoriek obličkového parenchýmu). Vyizolovali sme miRNA v potrebnom množstve a kvalite. Pomocou metódy Real-Time PCR sme získali hladiny expresie vybraných miRNA (miRNA-155, miRNA-141, miRNA-210, miRNA-200b, miRNA-200c, miRNA-106a, miRNA-106b, miRNA-182) u všetkých 48 študovaných vzorkách. Hladiny miRNA-155 (p<0,0001), miRNA-210 (p<0,0001), miRNA-106a (p<0,0001) a miRNA-106b (p<0,0001) boli signifikantne zvýšené v tumoroch, hladiny miRNA-141 (p=0,002) a miRNA-200c (p<0,0001)v boli v tumoroch štatisticky významne znížené. Hladiny miRNA-182 a miRNA-200b neboli v tumoroch ani nenádorovom parenchýme rozdielne. miRNA-106b sa zdá byť účinným prognostickým markerom času do relapsu pri pacientoch s ccRCC (Long-rank p=0,0324). Potvrdili sme niektoré skoršie pozorovania uskutočnené na menších súboroch pacientov pomocou hybridizačných mikročipoch. Ako prví sme identifikovali prognostický význam miRNA-106b, ktorý je potrebné validovať na širšom súbore pacientov.

Klíčová slova

renálny karcinóm, mikroRNA, VHL gén, nádorové supresory, onkogény

Jazyk práce: slovenština

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 13. 5. 2010

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 14. 6. 2010
• Vedoucí: doc. RNDr. Ondřej Slabý, Ph.D.

Masarykova univerzita

Přírodovědecká fakulta

Bakalářský studijní program / obor:
Biochemie / Biochemie