Druhová identifikace pomocí jaderných a mitochondriálních genů u kmene Arthropoda

Mgr. Ing. Tamara Mifková

Disertační práce

Species identification using nuclear and mitochondrial genes in the phylum Arthropoda

Anotace:

Výzkum genetické informace poskytuje nezbytné poznatky nejen pro druhovou identifikaci, ale je také zásadní pro komplexní studie, které se zabývají nejrůznějšími aspekty ekologie, biologie a chování členovců. Součástí této práce je soubor šesti publikací, které systematicky využívají jaderné a mitochondriální geny a ukazují několik způsobů, kterými lze tyto markery využít v rámci výzkumu členovců. Úvodní částí práce je shrnutí dosavadních poznatků z oblasti barcodingu a představuje souhrn nejčastěji se vyskytujících jaderných a mitochondriálních genů ve výzkumu členovců. Druhá část práce se zaměřila na význam DNA barcodingu pro identifikaci bezobratlých živočichů, zejména těch nalezených na mrtvých tělech obratlovců. Dále jsme se zaměřili na studium sezónní dynamiky a individuální potravní specializaci pavouků. Další práce byla věnována potravě pavouků v zimním období, která umožňuje lépe pochopit úlohu pavouků v boji proti škůdcům. Následně jsme zkoumali vliv bakterie Wolbachia na chování pavouků. Poslední práce se zabývá analýzou potravy ještěrek zelených, a srovnává dvě metody – makroskopický a molekulární přístup – pro identifikaci kořisti.

Abstract:

The study of genetic information not only provides essential knowledge for species identification, but is also crucial in complex studies dealing with various aspects of arthropod ecology, biology and behaviour. This thesis includes six publications that use nuclear and mitochondrial genes and show several ways in which these markers can be used in arthropod research. The introductory part of the thesis is a summary of the existing knowledge in the field of barcoding and presents a summary of the most frequently occurring nuclear and mitochondrial genes in arthropod research. The second part of the thesis focuses on the importance of DNA barcoding for the identification of invertebrates, especially those found on vertebrate carcasses. We also focused on the study of seasonal dynamics and individual feeding specialization of spiders. Further work was devoted to the roleplay of spiders in the winter season, which allows a better understanding of their role in pest suppression. Subsequently, we investigated the effect of Wolbachia on spider behavior. The last paper deals with the analysis of green lizard food, and compares two methods - macroscopic and molecular approaches - for prey identification.

Klíčová slova

jaderné geny, mitochondriální geny, DNA barcoding

Keywords

DNA barcoding, nuclear genes, mitochondrial genes

Jazyk práce: čeština

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 21. 9. 2023

Obhajoba závěrečné práce

• Vedoucí: prof. RNDr. Aleš Knoll, Ph.D.
• Oponent: Zdeněk Laštůvka, prof. RNDr., CSc., Zdeněk Faltýnek Fric, RNDr., Nina Moravčíková

Mendelova univerzita v Brně

Agronomická fakulta

Doktorský studijní program / obor:
Zootechnika / Molekulární biologie a genetika živočichů