Paralelizace obrazového simulátoru buněčných populací – Bc. David Wiesner
Bc. David Wiesner
Diplomová práce
Paralelizace obrazového simulátoru buněčných populací
Paralelization of the image simulator of cell populations
Anotace:
V oboru obrazové cytometrie se analyzuje výstup z optického mikroskopu pomocí komplexních algoritmů pro zpracování obrazu. K zajištění korektnosti těchto algoritmů je nutné důkladné testování v průběhu vývoje. K výrobě potřebných testovacích dat lze využít simulátory, které vytvoří realisticky vypadající obrazy s odpovídající anotací. Jedním z těchto simulátorů je MitoGen, simulační systém vyvíjený …víceAbstract:
The field of image cytometry utilizes complex image analysis algorithms to process the output from optical microscopes. The development and subsequent verification of these algorithms require thorough testing to warrant their correctness. Simulators generating artificial real-world resembling images with corresponding ground truth are employed to facilitate the production of necessary benchmark testing …víceKeywords
cell imaging virtual imaging simulation digital cell cell model cell populations digital phantom ground truth verification benchmarking testing image cytometry time-lapse MitoGen CBIA parallelization multi-threading C++11 Linux mutex scaling scheduling Fast Fourier Transform cmake EDF Earliest Deadline First optimization visualization implementation
Jazyk práce: angličtina
Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 12. 12. 2017
Identifikátor:
https://is.muni.cz/th/zncqs/
Obhajoba závěrečné práce
- Obhajoba proběhla 1. 2. 2018
- Vedoucí: RNDr. Vladimír Ulman, Ph.D.
- Oponent: prof. RNDr. Michal Kozubek, Ph.D.
Plný text práce
Obsah online archivu závěrečné práce
Zveřejněno v Theses:- světu
Jak jinak získat přístup k textu
Instituce archivující a zpřístupňující práci: Masarykova univerzita, Fakulta informatikyMasarykova univerzita
Fakulta informatikyMagisterský studijní program / obor:
Informatika / Paralelní a distribuované systémy