Paralelizace obrazového simulátoru buněčných populací – Bc. David Wiesner
Bc. David Wiesner
Master's thesis
Paralelizace obrazového simulátoru buněčných populací
Paralelization of the image simulator of cell populations
Abstract:
V oboru obrazové cytometrie se analyzuje výstup z optického mikroskopu pomocí komplexních algoritmů pro zpracování obrazu. K zajištění korektnosti těchto algoritmů je nutné důkladné testování v průběhu vývoje. K výrobě potřebných testovacích dat lze využít simulátory, které vytvoří realisticky vypadající obrazy s odpovídající anotací. Jedním z těchto simulátorů je MitoGen, simulační systém vyvíjený …moreAbstract:
The field of image cytometry utilizes complex image analysis algorithms to process the output from optical microscopes. The development and subsequent verification of these algorithms require thorough testing to warrant their correctness. Simulators generating artificial real-world resembling images with corresponding ground truth are employed to facilitate the production of necessary benchmark testing …moreKeywords
cell imaging virtual imaging simulation digital cell cell model cell populations digital phantom ground truth verification benchmarking testing image cytometry time-lapse MitoGen CBIA parallelization multi-threading C++11 Linux mutex scaling scheduling Fast Fourier Transform cmake EDF Earliest Deadline First optimization visualization implementation
Language used: English
Date on which the thesis was submitted / produced: 12. 12. 2017
Identifier:
https://is.muni.cz/th/zncqs/
Thesis defence
- Date of defence: 1. 2. 2018
- Supervisor: RNDr. Vladimír Ulman, Ph.D.
- Reader: prof. RNDr. Michal Kozubek, Ph.D.
Citation record
Full text of thesis
Contents of on-line thesis archive
Published in Theses:- světu
Other ways of accessing the text
Institution archiving the thesis and making it accessible: Masarykova univerzita, Fakulta informatikyMasaryk University
Faculty of InformaticsMaster programme / field:
Informatics / Parallel and Distributed Systems