Predikce substrátové specificity haloalkan dehalogenáz s využitím strojového učení – Bc. Michal Bubeník
Bc. Michal Bubeník
Diplomová práce
Predikce substrátové specificity haloalkan dehalogenáz s využitím strojového učení
Machine-learning based prediction of substrate specificity profiles for haloalkane dehalogenases
Anotace:
Tato práce se zabývá výpočetní predikcí substrátové specificity enzymů z rodiny haloalkan dehalogenáz, které mají řadu biotechnologických aplikací. Motivací je identifikace nových enzymů z této rodiny screeningem několika tisíc kandidátních sekvencí z databáze a aplikací připravených prediktorů na tyto sekvence, což je postup, který není možné provést experimentálně. Práce vychází ze změřených dat …víceAbstract:
This thesis deals with the computational prediction of substrate specificity of enzymes from the haloalkane dehalogenase family, which are of numerous biotechnological applications. The motivation is to identify new enzymes from this family by screening several thousand candidate sequences from a database and applying the prepared predictors to these sequences, as such a procedure could not be performed …více
Jazyk práce: angličtina
Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 16. 5. 2022
Identifikátor:
https://is.muni.cz/th/dw2d2/
Obhajoba závěrečné práce
- Obhajoba proběhla 13. 6. 2022
- Vedoucí: PhD Stanislav Mazurenko
- Oponent: Ing. Miloš Musil, Ph.D.
Citační záznam
Plný text práce
Obsah online archivu závěrečné práce
Zveřejněno v Theses:- světu
Jak jinak získat přístup k textu
Instituce archivující a zpřístupňující práci: Masarykova univerzita, Přírodovědecká fakultaMasarykova univerzita
Přírodovědecká fakultaMagisterský studijní program / obor:
Matematická biologie a biomedicína / Biomedicínská bioinformatika
Práce na příbuzné téma
-
Modelování vlivu podmínek prostředí na biologická společenstva s využitím metod strojového učení.
Hana Mlčochová -
Využití vybraných metod strojového učení pro modelování kreditního rizika
Matěj Drábek -
Aplikace strojového učení pro predikci odchodu zákazníků
Jan Hýbl -
Enzymy produkované probiotickou bakterií jako alternativa bezlepkové diety.
Michaela Šťastná -
Enzymy oxidativního stresu u extrémně acidofilních mikroorganismů
Marek Šťavík -
Vliv stáří a infekčního tlaku na enzymy obranné reakce rajčete
Michal Pístecký -
Analýza genů kódujících lytické enzymy účinné proti Propionibacterium acnes
Roman Baška -
Analýza genů kódujících lytické enzymy účinné proti koaguláza negativním stafylokokovým kmenům
Adela Švancárová