Studium zaměnitelnosti kovových iontů v lektinu BC2L-A z lidského patogenu Burkholderia cenocepacia

Bc. Petr Baroň

Bachelor's thesis

Study of metal ion interchangeability in BC2L-A lectin from Burkholderia cenocepacia

Anotácia:

Tato práce je zaměřena na studium lektinu BC2L-A z bakterie Burkholderia cenocepacia. Bakalářská práce vychází z předchozích studií lektinu BC2L-A a dalších homologních lektinů patřících do rodiny PA-IIL, jako jsou PA-IIL, RS-IIL a CV-IIL. Lektiny této rodiny mají ve vazebném místě dva Ca2+ ionty, které zprostředkovávají interakci se sacharidy. Cílem práce bylo nahradit ionty vápníku za jiný dvojmocný kov a ověřit vazebné vlastnosti proteinu pomocí aglutinace kvasinek. V bakalářské práci je uvedena metodika a výsledky experimentů popisujících přípravu kompetentních buněk, produkci lektinu BC2L-A, jeho purifikaci a eliminaci Ca2+, pokusy o nahrazení vápníku za jiné ionty kovů a ověření vazebných vlastností aglutinací. Bylo zjištěno, že ionty Mn2+, Cu2+ a Co2+ interagují s vazebným místem lektinu BC2L-A, nicméně vazebné vlastnosti lektinu nebyly zachovány.

Abstract:

The object of study is lectin BC2L-A from bacteria Burkholderia cenocepacia. The bachelor’s thesis uses information from other studies concerning lectin BC2L-A and other lectins from PA-IIL lectin family, like PA-IIL, RS-IIL and CV-IIL. Lectins that belong to this family carry two Ca2+ ions that mediate the interaction with saccharides. The main goal of this study was to replace calcium with other divalent metal ions and to verify the binding properties through yeast agglutination. Methods and experimental data describing the preparation of competent cells, production of BC2L-A, its purification and elimination of Ca2+. Also attempts to replace calcium with other metal ions and verification of binding properties is included. It was discovered that Mn2+, Cu2+ and Co2+ ions interact with binding site of BC2L-A lectin, however the binding properties of the lectin are not preserved.

Kľúčové slová

lektin, BC2L-A, ionty, kovy, vazebné místo, specifita, lectin, ions, metals, binding site, specificity

Jazyk práce: Czech

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 1. 6. 2021

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 7. 7. 2021
• Vedúci: prof. RNDr. Michaela Wimmerová, Ph.D.
• Oponent: MVDr. Eva Fujdiarová, Ph.D.

Masaryk University

Faculty of Science

Bachelor programme / odbor:
Biochemistry / Biochemistry