Glyceraldehyd-3-P-dehydrogenasa: protein mnoha tváří

Mgr. Lucia Slepánková

Bakalářská práce

Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase: the many faces of the protein

Anotace:

Glyceraldehyd-3-fosfát dehydrogenasa byl dlouhou dobu považován za klasický glykolytický enzym. Nedávné studie odhalily, že tento protein disponuje různými aktivitami při různých buněčných procesech. Tato práce je zaměřena na shrnutí některých jeho nově objevených funkcí. Především se jedná o vazebné schopnosti GAPDH s nukleovými kyselinami, vliv GAPDH na motilitu spermií. Dále byla zpracována problematika apoptozy a neurodegenerativních poruch s ní spojených. V neposlední řadě bylo shrnuto možné uplatnění GAPDH jako adhezivní molekuly při kolonizaci podmíněného patogenu Candida albicans. Praktická část je potom zaměřena na vypracování metodiky izolace genomové DNA pro další využití při klonování genu GAPDH. Vytvořený rekombinantní protein má být dále využit pro testování jeho schopnosti vázat sacharidové ligandy, a tím charakterizovat jeho adhezivní vlastnosti. Pro optimalizaci takovýchto experimentů by bylo možné využít i komerčně dostupného enzymu ze S. cerevisiae na základě značné homologie, která se podařila dokázat v praktické části bakalářské práce.

Abstract:

Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase was considered as a classical glycolytic protein. Recent studies have suggested that this protein displays diverse activities within cell mechanisms. This work is tagged to sum up some of its novel functions including translation control, DNA repair, binding to nucleic acids, gene expression during apoptosis and the role of GAPDH as a cellular phenotype age-related neuronal diseases. Last but not least to summarize GAPDH association with cell wall of Candida albicans and the role in adherence to human tissue, which support development of invasive candidiasis and next to acquaint with investigations to construct new anti-adhesive drugs. In the practical part, there was developed the method to isolate genomic DNA for further cloning of GAPDH gene. Resulting recombinant enzyme would be used for binding experiments to characterize its adhesive properities. Substantial homolgy of sequence and structure was demostrated between Candida albicans and Saccharomyces cerevisiae GAPDH, enabling to utilize a commercially accessible protein from S. cerevisiae for optimization of these experiments.

Klíčová slova

GAPDH, glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, Candida albicans

Jazyk práce: čeština

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 15. 5. 2009

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 16. 6. 2009
• Vedoucí: prof. RNDr. Michaela Wimmerová, Ph.D.

Masarykova univerzita

Přírodovědecká fakulta

Bakalářský studijní program / obor:
Biochemie / Biochemie