Velikost genomu vybraných zástupců cévnatých rostlin Tropické Afriky

Bc. Romana INDROVÁ

Master's thesis

Genome size of selected species of vascular plants from Tropical Africa

Abstract:

Cílem předkládané diplomové práce bylo změření velikosti genomu vybraných zástupců cévnatých rostlin pocházejících z oblasti Tropické Afriky pomocí průtokové cytometrie. Analyzované rostliny byly vypěstovány ze semen sbíraných na výškovém gradientu na horském masivu Mount Cameroonu v Kamerune. Celkově byla velikost genomu změřena pro 43 rostlinných druhů z 27 čeledí. Největší genom, 2C = 94,22 pg, měl Nephthytis poissonii z čeledě Araceae. Nejmenší velikost genomu, 2C = 0.83 pg, byla naměřena pro blíže neurčený druh Sarcophrynium sp. z čeledě Maranthaceae. Největší genom byl tedy 113.5 krát větší, než nejmenší genom. Při porovnání průměrných hodnot velikosti genomu mezi zastoupenými biomy na výškovém gradientu Mt. Cameroonu, byl pozorován trend klesání průměrné hodnoty velikosti genomu s rostoucí nadmořskou výškou. Tenhle trend byl pozorován jenom pro lesní biomy po horní hranici lesa. Průměrná hodnota velikosti genomu pro horskou savanu, tedy biom nad horní hranici lesa, je větší než pro horský deštný les. Lze se tedy domnívat, že vztah mezi průměrnou velikostí genomu a nadmořskou výškou není lineární. Získané výsledky poskytují cenný informace o velikosti genomu rostlinných druhů z Tropické Afriky a téměř v polovině případů se jedná dokonce o první informace o velikosti genomu pro daný rod.

Abstract:

The aim of the present Master thesis was to determine genome size of selected species of vascular plants from Tropical Africa by means of Flow Cytometry. Analysed plants were grown from seeds collected on altitudinal gradient on Mont Cameroon. Genome size was determined for 43 species from 27 families. The biggest genome, 2C = 94,22, pg was encountered for Nephthytis poissonii from family Araceae. The lowest genome size, 2C = 0.83 pg, was observed for an undetermined species Sarcophrynium sp. from family Maranthaceae. Thus the biggest genome was 113.5 times bigger than the lowest one. Comparing average values of genome sizes of plants from represented biomes on altitudinal gradient showed a pattern of decreasing genome size with increasing altitude. However, this trend was observed only for forest biomes. Average value of genome size for mountain savannah (above the upper tree line) was higher than for mountain forest. Thus, the pattern of average genome size and altitude is not linear. The results provide valued information on genome size of plants from Tropical Africa and almost half of them represent the first records on genome size for particular genera.

Keywords

průtoková cytometrie, velikost genomu, Tropická Afrika, Mount Cameroon

Language used: Czech

Date on which the thesis was submitted / produced: 30. 7. 2015

Accessible from:: 30. 7. 2015

Thesis defence

• Supervisor: RNDr. Luboš Majeský, Ph.D.

PALACKÝ UNIVERSITY OLOMOUC

Faculty of Science

Master programme / field:
Chemistry / CH-BI