Identifikace exozomálních nekódujících RNA s diagnostickým a prognostickým potenciálem v krevním séru pacientů s kolorektálním karcinomem.

Bc. Markéta Pavlíková

Master's thesis

Identification of serum exosomal non-coding RNAs with diagnostic and prognostic potential in colorectal cancer patients.

Abstract:

Hlavním tématem této diplomové práce je kolorektální karcinom, který se řadí mezi nádory s nejvyšší incidencí a mortalitou v České republice i ve světě a je poměrně pevně spjat s nezdravým životním stylem západní civilizace. Zavedení celoplošného screeningového programu v České republice se promítlo do lehkého poklesu v mortalitě a stabilizaci incidence, ale účast populace ve screeningu je příliš nízká pro větší efekt. Možnou příčinou je invazivita současných diagnostických metod, které navíc nevykazují dostatečnou citlivost a specificitu pro detekci onemocnění. Proto je vyvíjená velká snaha nalézt vhodné neinvazivní krevní markery, které u kolorektálního karcinomu v současnosti nejsou k dispozici. Diplomová práce je zaměřena na validaci potenciálně deregulovaných dlouhých nekódujících RNA, které by jako takové markery mohly sloužit. Jedná se o dlouhé nekódující RNA, které jsou do okolí buněk vylučovány v malých extracelulárních vezikulách a díky ochraně, kterou jim tyto vezikuly poskytují, mohou cestovat krevním řečištěm a uplatňovat svůj vliv na různých místech v organismu.

Abstract:

The main topic of this diploma thesis is colorectal cancer, which ranks among the tumors with the highest incidence and mortality in the Czech Republic and in the world and is relatively tightly linked to the unhealthy lifestyle of Western civilization. The introduction of a nationwide screening program in the Czech Republic resulted in a slight decrease in mortality and a stabilization of the incidence, but participation of the population in screening is too low for a greater effect. A possible cause is the invasiveness of current diagnostic methods, which, moreover, do not show sufficient sensitivity and specificity for disease detection. Therefore, a great effort is being made to find suitable non-invasive blood markers, which are currently not available for colorectal cancer. The thesis is focused on the validation of potentially deregulated long non-coding RNAs that could serve as such markers. These long non-coding RNAs are secreted into the environment of cells in small extracellular vesicles, and thanks to the protection provided by these vesicles, they can travel through the bloodstream and influence processes in various places in the body.

Keywords

kolorektální karcinom, biomarkery, malé extracelulární vezikuly, dlouhé nekódující RNA, diagnostický panel

Language used: Czech

Date on which the thesis was submitted / produced: 16. 5. 2023

Thesis defence

• Date of defence: 29. 6. 2023
• Supervisor: Mgr. Petra Vychytilová, Ph.D.
• Reader: RNDr. Jana Nekvindová, Ph.D.

Masaryk University

Faculty of Science

Master programme / field:
Experimental Animal Biology and Immunology / Immunology