Aplikace bioinformatických přístupů pro analýzu struktury rostlinných genomů – Mgr. Petra Hloušková, Ph.D.
Mgr. Petra Hloušková, Ph.D.
Doctoral thesis
Aplikace bioinformatických přístupů pro analýzu struktury rostlinných genomů
Bioinformatic approaches for structural analysis of plant genomes
Abstract:
Vyšší rostliny jsou známé svou extrémní variabilitou ve velikosti genomu, způsobenou buďto polyploidií a/nebo proliferací repetitivních sekvencí. Kromě jaderného genomu rostlinné buňky obsahují extranukleární, chloroplastové a mitochondriální genomy. Zejména chloroplastové sekvence představují užitečný zdroj informací pro řešení fylogenetických vztahů na různých taxonomických úrovních. Prvním cílem …moreAbstract:
Land plants are well known for their extensive genome size variation. The genome size range is primarily caused by polyploidy and/or proliferation of repetitive sequences. In addition to the nuclear genome, plant cells contain extranuclear, chloroplast and mitochondrial genomes. In particular, chloroplast sequences are useful to resolve the phylogenetic relationships at different taxonomic levels. …moreKeywords
Rostlinný genom Variabilita ve velikosti genomu Repetitivní DNA Transpozibilní elementy Retrotranspozony Tandemové repetice Chloroplastová DNA Fylogenetika Assembly Identifikace repetic Sekvenování nové generace Plant genome Genome size variability Repetitive DNA Transposable elements Retrotransposons Tandem repeats Chloroplast DNA Phylogenetics Repeat identification Next generation sequencing
Language used: English
Date on which the thesis was submitted / produced: 3. 3. 2020
Identifier:
https://is.muni.cz/th/cvbnu/
Thesis defence
- Date of defence: 24. 4. 2020
- Supervisor: prof. Mgr. Martin Lysák, Ph.D.
- Reader: Mgr. Eva Hřibová, Ph.D., Mgr. Vratislav Peška, Ph.D.
Citation record
ISO 690-compliant citation record:
HLOUŠKOVÁ, Petra. \textit{Aplikace bioinformatických přístupů pro analýzu struktury rostlinných genomů}. Online. Doctoral theses, Dissertations. Brno: Masaryk University, Faculty of Science. 2020. Available from: https://theses.cz/id/ksktzd/.
Full text of thesis
Contents of on-line thesis archive
Published in Theses:- světu
Other ways of accessing the text
Institution archiving the thesis and making it accessible: Masarykova univerzita, Přírodovědecká fakultaMasaryk University
Faculty of ScienceDoctoral programme / field:
Genomics and Proteomics / Genomics and Proteomics
Theses on a related topic
-
Velikost kinetochoru ve vztahu k velikosti chromozomů
Klára Plačková -
Mezipopulační variabilita ve tvaru a velikosti otisků ruky: důsledky pro odhad pohlaví pravěkých umělců
Markéta JAROŠOVÁ -
Variabilita ve velikosti genomu a průduchů taxonů rodu orsej (Ficaria) v Evropě
Michaela KONEČNÁ -
Variabilita ve velikosti vajec a snůšek u bahňáků
Zuzana Košťálová -
Variabilita ve velikosti genomu vybraných druhů rodu Chenopodium
Zuzana Koňáková -
Vnitrodruhová variabilita u žaberních parazitů ryb
Martin Zach -
Variabilita velikosti kapek jeskynních skapů
Tomáš Hejduk -
Estimating the copy-number of chromosomes using next-generation sequencing data
Peter Guman