Porovnání různých metod izolace genomové DNA hmyzu

Bc. Vojtěch Novák

Diplomová práce

Comparison of different methods of isolation genomic DNA from insects

Anotace:

Tato diplomová práce se zabývá popisem a ověřením různých metod izolace DNA z tkání hmyzu řádu Lepidoptera -- motýli, s důrazem na čeleď Sphingidae -- lišajovití a následnou amplifikací genu COI pomocí metody PCR. Testované metody se porovnávaly a vyhodnocovaly z hlediska účinnosti, výtěžku a čistoty DNA, délky trvání izolace a finanční náročnosti. Podařilo se stanovit metodiku, která je dostačující pro získání sekvence genu COI pomocí genetického analyzátoru, její aplikace do systému BoldSystems a následnou determinaci zkoumaného vzorku. To je důležité ve snaze o zmapování druhové diverzity.

Abstract:

This thesis deals with description and verification of different methods of DNA isolation from insect tissue of order Lepidoptera -- butterflies with an emphasis on family Sphingidae -- hawk moths and subsequent amplification of COI gene by PCR method. All tested methods were compared and evaluated in terms of efficiency, yield and purity of the DNA isolation, duration and financial costs. We selected to establish a methodology which is sufficient for obtaining COI gene sequences using genetic analyzer, its application in the system BoldSystems and subsequent determination of the sample. This is important in effort to map the species diversity.

Klíčová slova

čeleď lišajovití, izolace DNA, BOLD, gen COI, biodiverzita

Keywords

BOLD, DNA isolation, family Sphingidae, biodiversity, COI gene

Jazyk práce: čeština

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 29. 4. 2015

Obhajoba závěrečné práce

• Vedoucí: prof. RNDr. Aleš Knoll, Ph.D.
• Oponent: Kristína Civáňová, externi

Mendelova univerzita v Brně

Agronomická fakulta

Magisterský studijní program / obor:
Zootechnika / Živočišné biotechnologie