Mgr. Matěj Radvanský

Master's thesis

Identifikace biomarkerů ve střevní mikroflóře metodami statistiky a strojového učení.

Identification of biomarkers in human digestive tract by statistical and machine-learning methods.
Anotácia:
Tato práce se zabývá problematikou identifikace biomarkerů v sekvenačních datech. Popisuje postupy, jakými lze přiřadit sekvence k odpovídajícím organismům a poté jak identifikovat organismy, které významně ovlivňují průběh zkoumané nemoci. Hlavním výstupem práce je nástroj, kterým lze v sekvencích FASTQ nalézt významné organismy z hlediska nemoci. K tomu jsou využity metody jako alfa a beta diverzita …viac
Abstract:
This thesis is focused on biomarker identification in sequencing data. It describes techniques used for assigning sequences to organisms and on finding significant organisms in relation with examined disease. Some of used methods are alpha and beta diversity, feature selection with usage of tools like WEKA, Fizzy, Qiime and LEfSe. Result of this work is program for comparisson of stastical methods …viac
 
 
Jazyk práce: Czech
Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 22. 5. 2017

Obhajoba závěrečné práce

  • Obhajoba proběhla 23. 6. 2017
  • Vedúci: Ing. Matej Lexa, Ph.D.
  • Oponent: RNDr. David Šafránek, Ph.D.

Citační záznam

Plný text práce

Obsah online archivu závěrečné práce
Zveřejněno v Theses:
  • světu
Jak jinak získat přístup k textu
Instituce archivující a zpřístupňující práci: Masarykova univerzita, Fakulta informatiky