Identifikace biomarkerů ve střevní mikroflóře metodami statistiky a strojového učení. – Mgr. Matěj Radvanský
Mgr. Matěj Radvanský
Diplomová práce
Identifikace biomarkerů ve střevní mikroflóře metodami statistiky a strojového učení.
Identification of biomarkers in human digestive tract by statistical and machine-learning methods.
Anotace:
Tato práce se zabývá problematikou identifikace biomarkerů v sekvenačních datech. Popisuje postupy, jakými lze přiřadit sekvence k odpovídajícím organismům a poté jak identifikovat organismy, které významně ovlivňují průběh zkoumané nemoci. Hlavním výstupem práce je nástroj, kterým lze v sekvencích FASTQ nalézt významné organismy z hlediska nemoci. K tomu jsou využity metody jako alfa a beta diverzita …víceAbstract:
This thesis is focused on biomarker identification in sequencing data. It describes techniques used for assigning sequences to organisms and on finding significant organisms in relation with examined disease. Some of used methods are alpha and beta diversity, feature selection with usage of tools like WEKA, Fizzy, Qiime and LEfSe. Result of this work is program for comparisson of stastical methods …více
Jazyk práce: čeština
Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 22. 5. 2017
Identifikátor:
https://is.muni.cz/th/kzkdc/
Obhajoba závěrečné práce
- Obhajoba proběhla 23. 6. 2017
- Vedoucí: Ing. Matej Lexa, Ph.D.
- Oponent: RNDr. David Šafránek, Ph.D.
Citační záznam
Plný text práce
Obsah online archivu závěrečné práce
Zveřejněno v Theses:- světu
Jak jinak získat přístup k textu
Instituce archivující a zpřístupňující práci: Masarykova univerzita, Fakulta informatikyMasarykova univerzita
Fakulta informatikyMagisterský studijní program / obor:
Aplikovaná informatika / Bioinformatika
Práce na příbuzné téma
-
Velkoškálový výběr atributů
Jan Štercl -
Výběr atributů při dolování znalostí z textových dat
Filip Balák -
Vliv přírodních prostředků dentální hygieny na mikrobiom ústní dutiny
Veronika Brychtová -
Střevní a bukální mikrobiom v prvním roce života dětí
Jacek Marciniak -
Rakovina dutiny ústní a orální mikrobiom
Nikoleta Rosinová -
Mikrobiom – důležitý hráč v toxicitě sinic a s nimi spojených nežádoucích efektů
Michaela Štěpánská -
Orální mikrobiom: Nemalý hráč na velkém poli zdraví člověka
Kristýna Koželuhová -
Střevní mikrobiom ve vývoji lidských onemocnění
Tereza Válková