Genetická analýza smc5-6 mutant

Bc. Hana Skoupilová

Diplomová práce

Genetic analysis of smc5-6 mutants

Anotace:

V současné době jsou známy tři SMC (Structural Maintenance of Chromosomes) komplexy, které se podílejí na organizaci chromatinu a na procesech spojených s jeho dynamikou. Jsou to kohesin, kondensin a SMC5-6 komplex, jehož hlavní funkce nebyla doposud uspokojivě objasněna. Tato práce si klade za cíl nalézt funkční vztahy s interakčními partnery komplexu SMC5-6 a pomocí genetických metod poodhalit způsoby zapojení tohoto komplexu do různých DNA opravných mechanismů. Jako hlavní metoda byla prováděna genetická analýza pomocí fenotypizace kvasinkových kmenů S. pombe. Mutantní kmen S. pombe nse3-R254E byl křížen s kmeny, které nesly mutace v jiných proteinech nebo proteinových komplexech souvisejících s mechanismy homologní rekombinace a strukturou chromatinu. Byla prokázána nezastupitelná role SMC5-6 komplexu v těchto studovaných procesech.

Abstract:

There are three SMC (Structural Maintenance of Chromosomes) complexes known yet which are involved in the organization of chromatin and processes associated with its dynamics. They are the following: cohesin, condensin and SMC5-6 complex. The major function of the last named SMC5-6 complex has not been revealed yet. The main objective of this thesis was to study functional relationships between the SMC5-6 complex and its interaction partners. Genetic techniques were used to uncover the role of SMC5-6 complex in DNA repair pathways and chromatin organization mechanisms. Phenotyping of yeast strains S. pombe was used as the main method of the genetic analysis. The irreplaceable role of SMC5-6 complex in homologous recombination was proven by cross-breeding of the mutant strain of S. pombe nse3-R254E with strains carrying mutations in other proteins or protein complexes associated with the mechanisms of homologous recombination and chromatin structure.

Klíčová slova

SMC5-6 komplex, Nse3, genetická analýza, chromatin, homologní rekombinace, SMC5-6 complex, genetic analysis, homologous recombination

Jazyk práce: čeština

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 18. 5. 2015

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 4. 6. 2015
• Vedoucí: doc. Mgr. Jan Paleček, Dr. rer. nat.

Masarykova univerzita

Přírodovědecká fakulta

Magisterský studijní program / obor:
Biochemie / Genomika a proteomika