Charakterizace enterokoků rezistentních k vankomycinu a jejich epidemiologie v České republice

Bc. Kateřina Křesalová

Master's thesis

Characterization of vancomycin-resistant enterococci and their epidemiology in the Czech Republic

Abstract:

Rezistence mikroorganismů na antimikrobiální látky lze považovat za jeden z největších problémů lidstva. Vankomycin, patřící do skupiny glykopeptidů, je takzvaným záložním antibiotikem a používá se většinou v závažných případech infekce. Od 70. let 20. století se začala objevovat rezistence k tomuto antibiotiku u bakteriálního rodu Enterocccus. Výzkumy prokazují spojitost rezistence s užíváním avoparcinu jako růstového stimulantu pro hospodářská zvířata. Trvalá kolonizace bakterií může být zásadní při šíření vankomycin-rezistentních enterokoků (VRE), přičemž významné zastoupení má zejména u volně žijících zvířat. Ta bývají rezervoárem rezistencí a kvůli jejich chování (např. společenské chování, migrace, shánění potravy) je přenášejí na obrovské vzdálenosti. Teoretická část práce popisuje rod Enterococcus, glykopeptidová antibiotika a antibiotickou politiku ve světě, Evropě a v České republice. Také popisuje molekulární mechanizmy a typy rezistence ke glykopeptidům. Praktická část diplomové práce se zabývá izoláty VRE izolovaných z trusu havranů polních z lokalit Přerova. Pomocí metod molekulární biologie byly izoláty blíže charakterizovány, byl určen jejich epidemiologický původ a výsledky byly porovnány s literaturou.

Abstract:

Antimicrobial resistance is considered to be one of the largest problem of humankind. Vancomycin belongs to glycopeptides group of antibiotics. It is a reserve antibiotics and it is used only for cases of severe infection. From 70s of 20th century has begun to appear resistance to vancomycin in bacterial genus Enterococcus. Researches prove connection of this resistance with usage of avoparcine as a growth promoter for livestock. Pernament colonisation of vancomycin-resistant enterococci (VRE) could be crucial especially for wildlife. Wild animals are reservoir of resistance and because of their behaviour (e.g. social life, migration, and chasing food), they spread it to long distances. Theoretical part of this diploma thesis describes genus Enterococcus, glycopeptide antibiotics and antimicrobial policy in the world, Europe, and in the Czech Republic. Describes molecular principles of resistance to glycopeptides and types of this resistance. Practical part of the thesis is about isolates from rooks from Přerov. Isolates were characterised by methods of molecular biology, their epidemiological origin was determined and results were compared with literature.

Keywords

Enterokoky, Enterococcus, rezistence, vankomycin, antibiotikum, VRE, havran, avoparcin, glykopeptidy, plazmid, transpozon Enterococci, resistance, vancomycin, antibiotics, rook, avoparcine, glycopeptides, plasmid, transposon

Language used: Czech

Date on which the thesis was submitted / produced: 9. 5. 2018

Thesis defence

• Date of defence: 13. 6. 2018
• Supervisor: Mgr. Veronika Oravcová, Ph.D.
• Reader: Mgr. Iva Buriánková, Ph.D.

Masaryk University

Faculty of Science

Master programme / field:
Experimental Biology / Special Biology